Archaeplastida (filogenetik sınıflandırma)

Bu sayfanın amacı bir filogenetik ağaç sunmaktır Archaeplastida ( Plantae bir kladogram böyle son tanınan analizler olarak farklı gruplar (ya da taksa) arasındaki mevcut akrabalık ilişkileri, vurgulama demek ki, Archéplastides). Onları öneriyoruz. Bu sadece bir olasılıktır ve bilim camiasında kalan ana tartışmalar, bibliyografyadan önce aşağıda kısaca sunulmuştur.

Filogenetik ağaç

Burada sunulan kladogramın en son yayınlanan ve erişilebilir analizlerle tutarlı olması amaçlanmıştır. Mutlaka rıza göstermesi gerekmez ve her zaman makalenin altında belirtilen bibliyografyaya başvurulabilir.

▲ sembolü , filogenetik canlı ağacının hemen üst kısmına işaret eder. ► işareti , dikkate alınan grubun filogenetik sınıflandırmasını ifade eder. Ağacın ikiden fazla dal taşıyan herhangi bir düğümü, ele alınan grubun iç filogenisinin belirsizliğini gösterir .

Botanistlerin ve zoologların tipografik alışkanlıkları farklıdır. Burada, okuma kolaylığı açısından ve iki geleneksel alana giren bazı mevcut gruplar, cinsten daha yüksek olan taksonların adlarının tümü düz karakterlerle, cinslerin veya türlerin adları italik olarak yazılmıştır.

Bir taksonun ardından , bilindiği zaman ortaya çıkma periyodu aşağıdaki efsaneyle gösterilebilir: ( Plé ): Pleistosen ; ( Pli ): Pliyosen ; ( Mio ): Miyosen ; ( Oli ): Oligosen ; ( Eoc ): Eosen ; ( Pal ): Paleosen ; ( Cre ): Kretase ; ( Jur ): Jura ; ( Tri ): Triyas ; ( Per ): Permiyen ; ( Araba ): Karbonifer ; ( Dev ): Devoniyen ; ( Sil ): Silüriyen ; ( Ord ): Ordovisyen ; ( Camb ): Kambriyen ; ( Edi ): Ediacaran . Mümkünse daha fazla kesinlik için, ( - ): daha düşük; ( ~ ): orta; ( + ): üstün.

▲
- Archaeplastida
  - Glaucophyta veya Glaucocystophyceae
  - Metabionta
    - Rhodophyta ►
    - Chloroplastida veya Chlorobionta veya Viridiplantae
      - Chlorophyta s.s. ►
      - Streptophyta veya Charophyta s.l.
        Zygnematophyceae ►
        
        Plasmodesmophyta veya Streptophytina
        Charophyceae
        
        Embriyofit
        Marchantiophyta veya Hepaticophyta ►
        
        Stomatofit
        Bryophyta ►
        
        Tracheophyta veya Tracheobionta
        Lycophyta veya Lycopodiophyta ►
        
        Euphyllophyta
        Monilophyta
        Psilotidae
        
        ...
        Filicophyta ►
        
        Equisetophyta veya Sphenophyta ►
        
        Spermatofita
        Akrogimosperma
        Cycadophyta ►
        
        ...
        Pinophyta veya Coniferophyta ►
        
        Ginkgoales
        
        Magnoliophyta veya Angiospermae ►

Gelişmiş ağaç ▲ └─o Archaeplastida ├─o Glaucophyta ou Glaucocystophyceae │ ├─o Cyanophorales ou Cyanophoraceae │ ├─o Glaucocystales ou Glaucocystaceae │ └─o Gloeochaetales ou Gloeochaetaceae └─o Metabionta ├─o Rhodophyta ► └─o Chloroplastida ou Chlorobionta ou Viridiplantae ├─o Chlorophyta s.s. ► └─o Streptophyta ├─o Mesostigmatophyceae └─o Charophyta (paraphylétique) ├─o Chlorokybophyceae └─o ├─o Klebsormidiophyceae ou Klebsormidiales │ ├─o Klebsormidiaceae │ ├─o Elakatotrichaceae │ └─o Koliellaceae └─o Phragmoplastophyta ├─o Zygnematophyceae ► └─o Plasmodesmophyta ou Streptophytina ├─o Charophyceae ou Charales │ ├─o Aclistocharaceae │ └─o Characeae ├─o Coleochaetales ou Coleochaetaceae └─o Embryophyta ├─o Marchantiophyta ou Hepaticophyta ► └─o Stomatophyta ├─o Bryophyta ► └─o ├─o Anthocerotophyta │ ├─o Leiosporocerotales ou Leiosporocerotaceae │ └─o Anthocerotopsida │ ├─o Anthocerotales ou Anthocerotaceae │ └─o Notothyladales │ ├─o Notothyladaceae │ │ ├─o Notothyladoideae │ │ └─o Phaeocerotoideae │ └─o Dendrocerotaceae │ ├─o Megacerotoideae │ └─o Dendrocerotoideae └─o Polysporangiophyta ├─o Horneophyttopsida (éteint) └─o ├─o Aglaophyton (éteint) └─o ├─o Rhyniopsida (éteint) └─o Tracheophyta ou Tracheobionta ├─o Lycophyta ou Lycopodiophyta ► └─o Trimerophyta (paraphylétique) ├─o Eophyllophyton (éteint) ├─o Psilophyton (éteint) └─o Euphyllophyta ├─o Monilophyta ou Pteridophytanae │ ├─o Cladoxylopsida ou Cladoxylales (éteint) │ └─o Polypodiopsida s.l. │ ├─o Stauropteridales (éteint) │ └─o │ ├─o Zygopteridales ou Zygopteridaceae (éteint) │ │ ├─o Clepsydroideae (éteint) │ │ └─o Etapteroideae (éteint) │ ├─o Psilotidae │ │ ├─o Ophioglossopsida ou Ophioglossales │ │ └─o Psilopsida ou Psilophyta │ │ ├─? Barinophytales (éteint) │ │ └─o Psilotales │ └─o │ ├─o Filicophyta ► │ ├─o Equisetophyta ou Sphenophyta ► │ └─o Marattiales │ ├─o Asterothecaceae (éteint) │ └─o Marattiaceae └─o Lignophyta ├─o Aneurophytales (éteint) └─o ├─o Archaeopteridales (éteint) └─o ├─o Protopityales (éteint) └─o Spermatophyta s.s. ├─o Calamopityaceae (éteint) ├─o Hydraspermaceae (éteint) └─o ├─o Lyginopteridaceae (éteint) └─o ├─o Medullosales (éteint) │ ├─o Potonieaceae (éteint) │ ├─o Alethopteridaceae (éteint) │ ├─o Neurodontopteridaceae (éteint) │ └─o Cyclopteridaceae (éteint) └─o Gymnospermae (paraphylétique) ├─o Acrogymnospermae │ ├─o Cycadophyta ► │ └─o │ ├─o Coniferophyta ou Pinophyta ► │ └─o Ginkgoales │ ├─o Karkeniaceae (éteint) │ └─o Ginkgoaceae └─o ├─o Callistophyta (éteint) └─o Glossophyta ├─o Glossopteridaceae (éteint) ├─o Czekanowskiaceae (éteint) ├─o Peltaspermales (éteint) │ ├─o Peltaspermaceae (éteint) │ └─o Corystospermaceae (éteint) ├─o Caytoniaceae (éteint) ├─o Gigantonomiaceae (éteint) └─o ├─o Pentoxylales (éteint) └─o ├─o Bennettitales ou Cycadeoidales (éteint) └─o Magnoliophyta ou Angiospermae ►

Glaucocystis sp hücresi . mikroskop görünümü
Laurencia sp. ( Floridaophyceae , Ceramiales , Rhodomelaceae )
Chondrus crispus (AD) ve Gigartina mamillosa (EF) ( Floridaophyceae , Gigartinales , Gigartinaceae )
Orchis longicornu ( Monocotyledoneae , Asparagales , Orchidaceae )
Drosera capensis ( Eudicotyledoneae , Polygonales , Droseraceae )
Dev kaktüsler , Bolivya ( Eudicotyledoneae , Polygonales , Cactaceae )
Grimmia pulvinata ( Bryophyta , Grimmiaceae )
Encephalartos woodii ( Cycadophyta , Zamiaceae )
Dicksonia antarktika ( Filicophyta , Dicksoniaceae )
Sequoia sempervirens ( Pinophyta , Cupressaceae ), Redwood Ulusal Parkı ( California )
Equisetum telmateia ( Sphaenophyta , Equisetaceae )

Archaeplastida'nın filogenisi üzerine bilimsel tartışma

Yukarıdaki ağaçta ana tartışma soruları şunlardır:

Archeplastidlerin kendilerinin monofilliği, " bitkiler " arasındaki endosimbiyozlarla bağlantılı bir soru : adından da anlaşılacağı gibi archeplastid kavramı, tüm grubun tabanında birincil bir endosimbiyoz , " kahverengi çizgi " de kloroplastların varlığını varsayar. ”( Stramenopiles ) ve diğer protist“ algler ”, dikkate alınan çizgilerdeki daha yakın zamanda ikincil endosimbiyoz tarafından açıklanmıştır - ki bu bugün tartışmalıdır;
Bunun yerin, bu soruya ilişkin Rhodophytes kardeşi grubuna: Viridiplantae veya tüm olan hücreleri kloroplast'lar içerir Bicontes ait?
- Yoon ve arkadaşları tarafından 2010 yılında yayınlanan inceleme , Glaucophytes'in gövdeden daha önce ayrıldığı Plantae monophylia'yı ve Kırmızı Yosun ile Yeşil Bitkiler arasındaki kardeş-grup ilişkisini tanıyor .
Zygnematophytes'in Charales'e göre yeri: Embryophytes'in kardeş grubu nedir ?
monofili ve Coléochétophycées ve Charophycées ile olan ilişkilerine dair yer ss ;
Bryophytes'e göre Anthocerotların yeri : Polysporangiophytes'in kardeş grubu nedir?
Marattiales'in Monilophytes içindeki yeri; Equisetophytes veya Filicophytes kardeş grubu?
günümüz Gymnospermlerinin monofili ve Kapalı tohumluların soyu tükenmiş taksonlarla akrabalıkları .

Embriyofitler ile ilgili olarak, burada sunulan ağaç, Angiosperm Phylogeny Web Sitesi tarafından sunulan en son çalışmanın özetini oldukça sadık bir şekilde takip etmektedir .

Cavalier-Smith 1998'e göre sınıflandırma

Bu sınıflandırma tam anlamıyla filogenetik değildir. Yeni filogenilere dayanarak, yine de kolaylık sağlamak için özellikle evrimsel çizgilerin tabanında parafiletik taksonları muhafaza eder. Ayrıca geleneksel sınıflandırma düzeylerini de (krallıklar, filumlar, sınıflar vb.) Korur.

Cavalier-Smith 1998'e göre sınıflandırma ▲ └─o règne des Plantae ├─o sous-règne des Biliphyta (peut-être paraphylétique) │ ├─o infra-règne des Glaucophyta │ │ └─o embranchement des Glaucophyta │ └─o infra-règne des Rhodophyta │ └─o embranchement des Rhodophyta │ ├─o sous-embranchement des Rhodellophytina (peut-être paraphylétique) │ │ └─o classe des Rhodellophyceae │ └─o sous-embranchement des Macrorhodophytina │ ├─o classe des Bangiophyceae │ └─o classe des Florideophyceae └─o sous-règne des Viridaeplantae ou Viridiplantae ├─o infra-règne des Chlorophyta │ └─o embranchement des Chlorophyta │ ├─o sous-embranchement des Chlorophytina │ │ ├─o infra-embranchement des Prasinophytae (paraphylétique) │ │ │ ├─o classe des Micromonadophyceae │ │ │ │ ├─o ordre des Mamiellales │ │ │ │ ├─o ordre des Pyramimonadales │ │ │ │ └─o ordre des Mesostigmatales │ │ │ └─o classe des Nephrophyceae │ │ └─o infra-embranchement des Tetraphytae │ └─o sous-embranchement des Phragmophytina │ ├─o infra-embranchement des Charophytae │ │ └─o classe des Charophyceae │ │ └─o ordre des Charales │ └─o infra-embranchement des Rudophytae │ ├─o classe des Eophyceae │ │ ├─o sous-classe des Stichophycidae │ │ │ ├─o ordre des Chlorokybales │ │ │ └─o ordre des Klebsormidiales │ │ └─o sous-classe des Chaetophycidae │ │ └─o ordre des Coleochaetales │ └─o classe des Conjugophyceae │ ├─o ordre des Desmidiales │ └─o ordre des Zygnematales └─o infra-règne des Cormophyta ├─o embranchement des Bryophyta │ ├─o sous-embranchement des Hepaticae │ ├─o sous-embranchement des Anthocerotae │ └─o sous-embranchement des Musci │ ├─o infra-embranchement des Sphagneae │ └─o infra-embranchement des Bryatae └─o embranchement des Tracheophyta ├─o sous-embranchement des Pteridophytina (paraphylétique) │ ├─o infra-embranchement des Psilophytae │ ├─o infra-embranchement des Lycophytae │ ├─o infra-embranchement des Sphenophytae │ └─o infra-embranchement des Filices (peut-être paraphylétique) └─o sous-embranchement des Spermatophytina ├─o infra-embranchement des Gymnospermae └─o infra-embranchement des Angiospermae

Nozaki ve diğerlerine göre basitleştirilmiş filogenetik ağaç . 2003

Analiz, plastit organizmalar üzerinde duruldu Discicrists , Stramenopiles'e ve Alveolates yapma büyük clade içinde bulunan Archaeplastida paraphyletic. Rhodophytes tabanına yakın bir çizgi olacaktır Bicontes (mitokondri olmayan organizmaların belirlenmemiş yere bağlıdır). Rhizaires'in yeri belirtilmemiştir.

Nozaki ve diğerlerine göre basitleştirilmiş filogenetik ağaç . 2003 └─o Plantae ├─o Rhodophyta └─o ├─o Glaucophyta └─o ├─o Viridiplantae └─o ├─o Discicristata │ ├─o Heterolobosea │ └─o │ ├─o Kinetoplastida │ └─o Euglenozoa └─o Chromalveolata ├─o Heterokontophyta └─o Alveolata ├─o Apicomplexa └─o Ciliophora

Adl ve ark. Tarafından önerilen sınıflandırma . 2005

Bu komite, eski Protistlerin yerini alan ve son moleküler soyoluşları dikkate alan yeni bir sınıflandırma önerdi . Ökaryotları monofiletik olduğu bilinen altı gruba ayırır. İşte Archaeplastida'yı ilgilendiren şey .

Adl ve ark. Tarafından önerilen sınıflandırma . 2005 ▲ └─o Archaeplastida ├─o Glaucophyta ├─o Rhodophyceae └─o Chloroplastida ├─o Chlorophyta │ ├─o Ulvophyceae │ ├─o Trebouxiophyceae │ └─o Chlorophyceae ├─o Chlorodendrales ├─o Prasinophytae (paraphylétique) ├─o Mesostigma └─o Charophyta └─o Streptophytina ├─o Charales └─o Plantae

Daha fazlasını bul

: Bu makale için kaynak olarak kullanılan belge.

Bibliyografik kaynaklar

Cheong Xin Chan, Eun Chan Yang, Titas Banerjee, Hwan Su Yoon, Patrick T. Martone, José M. Estevez ve Debashish Bhattacharya: "Kırmızı Alg Genlerinin Zengin Bir Repertuarında Bulunan Kırmızı ve Yeşil Algal Monofil ve Kapsamlı Gen Paylaşımı" , Güncel Biyoloji , cilt. 21, 2011, s. 328-333
Hwan Su Yoon, Giuseppe C. Zuccarello ve Debashish Bhattacharya: "Evolutionary History and Taxonomy of Red Algae" , J. Seckbach ve D. Chapman eds. : "Genomik Çağda Kırmızı Algler", Hücresel Köken, Aşırı Habitatlarda Yaşam ve Astrobiyoloji , cilt. 13, Springer, 2010, s. 25-42
Philip D. Cantino, James A. Doyle, Sean W. Graham, Walter S. Judd, Richard G. Olmstead, Douglas E. Soltis, Pamela S. Soltis ve Michael J. Donoghue: "Tracheophyta'nın filogenetik isimlendirmesine doğru" , Takson , uçuş. 56, n ° 3, elektronik ek, s. 1-44, 2007
Jose EB de la Torre, Mary G. Egan, Manpreet S. Katari, Eric D. Brenner, Dennis W. Stevenson, Gloria M. Coruzzi ve Rob DeSalle: "Bitki soyoluşunun ESTimasyonu: bölümlemeden dersler" , BMC Evolutionary Biology , 6: 48, 2006
Sina M. Adl ve diğerleri : " Ökaryotların Yeni Yüksek Düzey Sınıflandırması ", J. Eukaryot. Microbiol. , uçuş. 52, sayı 5, 2005, s. 399-451
Kathleen M. Pryer, Eric Schuettpelz, Paul G. Wolf, Harald Schneider, Alan R. Smith ve Raymond Cranfill: "Erken leptosporangiate farklılıklarına odaklanarak eğrelti otlarının (monilofitlerin) filogeni ve evrimi" , American Journal of Botany , cilt. 91, n ° 10, 2004, s. 1582–1598
Peter R. Crane, Patrick Herendeen ve Else Marie Friis: " Fosiller ve bitki soyoluşu ", American Journal of Botany 91 (10), 2004, s. 1683–1699
Hwan Su Yoon, Jeremiah D. Hackett, Claudia Ciniglia, Gabriele Pinto ve Debashish Bhattacharya (2004) " Fotosentetik Ökaryotların Kökeni için Moleküler Zaman Çizelgesi ", Mol. Biol. Evol. 21 (5) s. 809-818
Hisayoshi Nozaki ve diğerleri (2003) "Kırmızı Alglerin filogenetik konumu, mitokondri içeren ökaryotlardan gelen çoklu nükleer genler ve plastitlerin kökeni üzerine alternatif bir hipotez tarafından ortaya çıkarıldı", J. Mol. Evol. 56 s. 485-497
Thomas Cavalier-Smith (1998) “Gözden geçirilmiş altı krallık yaşam sistemi”, Biological reviews 73, s. 203-266