Nükleozom



Nükleozom hakkında toplayabildiğimiz bilgiler, mümkün olduğunca yararlı olması için dikkatlice kontrol edildi ve yapılandırıldı. Muhtemelen buraya Nükleozom hakkında daha fazla bilgi edinmek için geldiniz. İnternette, Nükleozom hakkında konuşan ve yine de Nükleozom hakkında bilmek istediklerinizi sunmayan sitelerin karmaşasında kaybolmak kolaydır. Aşağıdaki Nükleozom hakkında okuduklarınızı beğendiyseniz, yorumlarda bize bildireceğinizi umuyoruz. Nükleozom hakkında size sağladığımız bilgiler aradığınız şey değilse, bu siteyi her gün iyileştirebilmemiz için lütfen bize bildirin.

.

Nükleozom bir parçasını ihtiva eden bir kompleks DNA kalp oluşan sarılı nükleotit 146 ya da 147 çiftlerinden proteinler ( histonlar ). Gelen ökaryotlar , nucleosome temel kuruluş birimi olan kromatin . Çekirdekteki ilk DNA sıkıştırma düzeyini temsil eder, geometrisi genellikle bir makaranın etrafına sarılmış bir telinkiyle karşılaştırılır.

Bir nükleozomun kristal yapısı . Histonlar H2A , H2B , H3 ve H4 renkli ve gri DNA ile. (PDB: 1EQZ ))

DNA çift sarmalının erişilebilirliğini kontrol ederek nükleozom, DNA transkripsiyonu , replikasyonu veya onarımı gibi çeşitli nükleer işlemlerin düzenlenmesinde doğrudan rol oynar . Ayrıca düzenlemeye yardımcı epigenetik arasında gen ekspresyonu yoluyla, modifikasyon bazı bölgelerinin aktif veya sessiz doğası belirleyen, histonların genomu , adı verilen bir işlem histon kodu .

Yapısı

Kalp parçacığı

Nükleozomun (veya nükleozomal çekirdeğin) çekirdek parçacığı, etrafına yaklaşık 146 baz DNA çiftinin sarıldığı sekiz histon proteininden (her biri H2A , H2B , H3 ve H4 histonlarının iki kopyası ) oluşan bir protein çekirdeğinden oluşur . döner. Tamamı, 205 kDa'lık bir kütle için (her biri bu kütlenin yarısına katkıda bulunan histonlar ve DNA) 11 nm çapında ve 5.5  nm yüksekliğinde bir silindir oluşturur  .

Kromatin içinde çekirdek partiküller, bağlayıcı DNA segmentleri ile birbirinden ayrılır . Açıkça söylemek gerekirse , nükleozom terimi, bir çekirdek partikül ve bitişik bağlayıcı DNA tarafından oluşturulan seti ifade eder, ancak sıklıkla yalnızca çekirdek partikülü belirtmek için kullanılır.

Çekirdek parçacık, DNA sıkıştırmasının ilk seviyesini oluşturur: histonların oktamerinin etrafına sarılmış 146 baz çifti, aynı uzunluktaki çıplak bir DNA fragmanından altı kat daha kompakttır.

Kromatozom

Kromatozom, H1 bağlayıcı histonun çekirdek partikül ile birleşmesiyle oluşur. Histon H1, kalp partikülüne girdiği ve çıktığı yerde DNA'yı bağlar. Yaklaşık otuz baz çiftine giren ve çıkan bağlanan DNA'ların bir araya gelmesini sağlayarak hareketlerini sınırlandırır ve böylece nükleoprotein kompleksini kapatır.

H1 histonları dışındaki proteinler, DNA bağlama ajanlarını bağlayabilir. Bunlardan topluca "bağlayıcı proteinler" olarak bahsedilmesi ve kromatozom tanımının, bir histon olsun veya olmasın, bir çekirdek partikül ile bir bağlayıcı protein arasındaki herhangi bir ilişkiyi içerecek şekilde genişletilmesi önerilmiştir. Bağlanan proteinin doğasının, hem nükleozomun özelliklerini hem de kromatinin daha yüksek dereceli yapılar ( 30 nm'lik kromatin lifi  gibi) oluşturma yeteneğini etkilediği varsayılır .

Nükleofilament

Bir elektron mikroskobu altında gözlenen civciv eritrosit yoğunlaşmamış kromatin nükleofilamentleri . Bağlanan DNA'lar (beyaz uçlar) ile ayrılan çekirdek parçacıklar (siyah uçlar) dizisi, bu yapıya “inci kolye” adını vermiştir. Ölçek: 50  nm .

Nükleozom dizisi, 11 nm kromatin lifi veya resimsel olarak "inci kolye" olarak da adlandırılan  bir nükleofilaman oluşturur . Çekirdek partiküller, türler ve dokular arasında uzunlukları tomurcuklanan mayada 25 baz çifti ile ekinodermlerin sperminde 70 baz çifti arasında değişen DNA bağlayıcı segmentleriyle ayrılmış olarak görünür .

Bu gözlemlenen ilk kromatin yapısı olmasına rağmen, nükleofilaman muhtemelen kromatinin zayıf iyonik kuvvetlere maruz kalmasından kaynaklanan deneysel bir artefakttır, nükleozom dizileri hiçbir zaman bir konformasyonu benimsemeyen fizyolojik koşullar altında da genişler.

Biyokimya

Histonların amino terminal uçları, nükleozomun küresel kısmının dışına çıkar ve spesifik enzimler (histon-asetiltransferaz ve histon-deasetilaz, histon-metilaz, histon-kinaz, ubikitinaz, vb.) Tarafından katalize edilen kovalent modifikasyonlara tabi tutulur . Bu modifikasyonlar, nükleozomun sıkıştırılmasını modifiye ederek veya transkripsiyon faktörlerinin spesifik görevlendirilmesini işaret eden bir kod oluşturarak hareket edebilir .

Nükleozomlar ayrıca, yeniden modelleme kompleksleri eylem zinciri aktivitesi ATPase , SWI2 / SnF2 tipi altında DNA boyunca hareket ettirilebilir .

Archaea nükleozomu

Başlangıçta için spesifik olarak kabul ökaryotlar , nucleosome da belli bulunmaktadır archaea . Ökaryotik histonlara homolog proteinler, Euryarchaeota'nın çoğu türünde tanımlanmıştır . Archean nükleozomu, etrafına yaklaşık 60 baz çiftinden oluşan bir DNA parçasının sarıldığı bu Archean histonlarının bir tetramerinden oluşur. Bu tetramerik nükleozomun yapısı , ökaryotik nükleozomun kalbindeki H3 - H4 tetramerin yapısına çok benzer görünmektedir . Ökaryotik muadili ile aynı DNA sıkıştırma ve transkripsiyon düzenleme işlevlerini yerine getirir.

Notlar ve referanslar

  1. (inç) Timothy J. Richmond , Karolin Luger , Armin W. Mader ve Robin K. Richmond , 2.8 A çözünürlükte nükleozom çekirdek parçacığının kristal yapısı  " , Nature , cilt.  389, n o  6648,, s.  251–260 ( DOI  10.1038 / 38444 , çevrimiçi okuyun )
  2. Harp JM, Hanson BL, Timm DE, Bunick GJ, “  2.5 A çözünürlükte nükleozom çekirdek parçacığının X-ışını yapısı.  " , RCSB Protein Veri Bankası (PDB),( DOI  10.2210 / pdb1eqz / pdb , erişim tarihi 8 Ekim 2012 )
  3. Harp JM, Hanson BL, Timm DE, Bunick GJ, "  2.5 A çözünürlükte nükleozom çekirdek partikülündeki asimetriler  ", Acta Crystallographica Bölüm D , cilt.  56, n o  Pt 12,, s.  1513–34 ( PMID  11092917 , DOI  10.1107 / S0907444900011847 , çevrimiçi okuyun )
  4. Annabelle Gérard, Sophie Polo ve Geneviève Almouzni , "  Kod adı: histonlar  ", Pour la science , n o  46,( ISSN  0153-4092 , çevrimiçi okuyun )
  5. Brian D. Strahl ve C. David Allis , "  Kovalent histon modifikasyonlarının dili  ", Nature , cilt.  403,, s.  41–45 ( DOI  10.1038 / 47412 , çevrimiçi okuyun )
  6. Olins ve Olins 2003
  7. Harp vd. 2000
  8. van Holde ve Zlatanova 1999
  9. Zlatanova, Seebart ve Tomschik 2008
  10. Woodcock 2006
  11. Hansen 2002
  12. White and Bell 2002
  13. Reeve, Sandman ve Daniels 1997

Ayrıca görün

Kaynakça

  • (en) Jeffrey C. Hansen , Çözeltideki kromatin fiberin konformasyonel dinamikleri: belirleyiciler, mekanizmalar ve fonksiyonlar  " , Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. , cilt.  31,, s.  361–392 ( PMID  11988475 , DOI  10.1146 / annurev.biophys.31.101101.140858 )
  • (tr) Joel M. Harp , B. Leif Hanson , David E. Timm ve Gerard J. Bunick , 2.5 A çözünürlükte nükleozom çekirdek parçacığındaki asimetriler  " , Açta Crystallogr. D Biol. Crystallogr. , cilt.  56, n o  12,, s.  1513–1534 ( PMID  11092917 )
  • (tr) Donald E. Olins ve Ada L. Olins , Kromatin tarihi: köprüden bakışımız  " , Nature Reviews Molecular Cell Biology  (en) , cilt.  4, n o  10,, s.  809–814 ( PMID  14570061 , DOI  10.1038 / nrm1225 )
  • (tr) John N. Reeve , Kathleen Sandman ve Charles J. Daniels , Archaeal histonlar, nükleozomlar ve transkripsiyon başlatma  " , Cell , cilt.  89, n o  7,, s.  999–1002 ( PMID  9215621 , çevrimiçi okuma )
  • (en) Malcolm F. White ve Stephen D. Bell , Bir arada tutmak: Arkelerde kromatin  " , Trends Genet. , cilt.  18, n o  12,, s.  621–626 ( PMID  12446147 )
  • (en) Christopher L. Woodcock , Chromatin mimarisi  " , Curr. Opin. Struct. Biol. , cilt.  16, n o  2, s.  213-220 ( PMID  16.540.311 , DOI  10.1016 / j.sbi.2006.02.005 )
  • (en) Jordanka Zlatanova , Corrine Seebart ve Miroslav Tomschik , Bağlayıcı-protein ağı: nükleozomal DNA erişilebilirliğinin kontrolü  " , Trends Biochem. Sci. , cilt.  33, n o  6,, s.  247-253 ( PMID  18.468.442 , DOI  10.1016 / j.tibs.2008.04.001 )
  • (tr) Kensal van Holde ve Jordanka Zlatanova , Nükleozom çekirdek parçacığı: yapısal ve fizyolojik ilgisi var mı  " , BioEssays , cilt.  21, n o  9,, s.  776–780 ( PMID  10462418 , DOI  10.1002 / (SICI) 1521-1878 (199909) 21: 9 <776 :: AID-BIES9> 3.0.CO; 2-Z )

İlgili Makaleler

Nükleozom hakkında topladığımız bilgileri yararlı bulduğunuzu umuyoruz. Cevabınız evet ise, lütfen bizi arkadaşlarınıza ve akrabalarınıza tavsiye etmeyi unutmayın ve bize ihtiyacınız olduğunda her zaman bizimle iletişime geçebileceğinizi unutmayın. Tüm çabalarımıza rağmen, _title hakkında sunduğumuz şeyin tamamen doğru olmadığını veya bir şeyler eklememiz veya düzeltmemiz gerektiğini düşünüyorsanız, bize bildirirseniz minnettar oluruz. Nükleozom ve diğer herhangi bir konu hakkında en iyi ve en kapsamlı bilgiyi sağlamak bu web sitesinin özüdür; ansiklopedi projesinin yaratıcılarına ilham veren aynı ruh tarafından yönlendiriliyoruz ve bu nedenle bu web sitesinde Nükleozom hakkında bulduklarınızın bilginizi genişletmenize yardımcı olduğunu umuyoruz.

Opiniones de nuestros usuarios

Levent ünlü

Benim gibi Nükleozom hakkında bilgi arayanlar için bu çok iyi bir seçenek.

Mehmet Turgut

Teşekkürler. Nükleozom ile ilgili makale bana yardımcı oldu.

Tahir ünal

Nükleozom'dan güzel makale.