Komorlar ayrılıkçı krizi arasında 1997 adalarının bağımsızlık nöbet olan Anjouan ve Moheli gelen Komorlar İslam Federal Cumhuriyeti ilaveten oluşturulan Grande Comore , üçüncü ada ve büyük. İlk bağımsızlık ilanı Anjouan'da gerçekleşti2 Ağu 1997Mohéli, 11 Ağu 1997. 1991'de Mohéli bağımsızlığını çoktan iddia etmişti .
21 Temmuz 1997 Pazartesi günü, Anjouan Bağımsızlık Örgütü'nün (OPIA) destekçileri, o sırada bulunmayan valinin ofislerini ele geçirir ve adayı "Anjouanailere ait" olarak ilan eden Abdallah İbrahim'in başkanlık ettiği bir siyasi rehber oluşturur . ve "14 Temmuz 1997'den beri Fransız Cumhuriyeti'ne resmen bağlı" ; o gün, ayrılıkçı bir gösteri sırasında ve Mutsamudu'da Fransa'ya entegrasyon lehine iki kişi öldü ve birkaç jandarma yaralandı.
2 Ağustos 1997'de Anjouan adanın bağımsızlığını ilan etti; Said Abeid Abdérémane ulusal koordinatördür, ancak güç aslında Mohamed Bacar'ın elinde . 11 Ağustos 1997'de Mohéli bağımsızlığını ilan etti; Said Mohamed Souef cumhurbaşkanı ve Soidri Ahmed başbakan olur . Bu ayrılma girişimi , Komorlar Federal İslam Cumhuriyeti ve Afrika Birliği Örgütü (daha sonra nüfus için trajik olduğu anlaşılan) tarafından yönetilen bir ambargoya yol açtı .
Bu süreçte Mohéli adası, ardından Anjouan adası da Fransa'ya siyasi bağlılığını sorar , üç renkli bayrak çekilir ve Marsilya bile söylenir.
Fransa, Jacques Chirac aracılığıyla bu talebi görmezden geliyor. Fransa'nın Komorlar veya OAU ile ilişkilerini soğutmak istemediği ya da Mayotte'nin "mali perfüzyon" altındaki durumuyla kıyaslanabilecek bir durum istemediği gerçeğini açıklama olarak verebiliriz .
Merkezi iktidar daha sonra otoritesini zorla yeniden kazanmaya çalışır. 4 Eylül 1997ama askeri ve politik olarak başarısız oluyor. Himayesinde iken OAU , Moheli yine kabul Moroni'nin yetkisini , Anjouan hala reddediyor. Komorya Başkanı Mohamed Taki Abdulkarim 6 Kasım 1998'de öldüğünde, federasyon herhangi bir uzlaşma için uygun olmayan bir anayasal boşlukta kaldı .
Anjouanese müzakere, baskı altında, kabul sona erdi Antananarivo , ancak Anjouan yetkilileri sonuçta reddetti 23 Nisan 1999 Abdallah İbrahim ilgili anlaşmalar, Abeid, Ulusal Koordinatör etmek, emanet gücü istifa etti. 9 Ağu 2001Abeid, jandarma tarafından Bacar lehine bir darbe ile görevden alınır.
Bacar daha sonra, Grande Comore'da adaların çok geniş bir özerkliğe sahip olduğu yeni bir oluşum olan Komorlar Birliği'ni yaratmak için iktidarı ele geçirmesinin ardından Azali Assoumani ile uzun bir siyasi uzlaşma sürecini başlatır . Bacar, Abeid liderliğindeki biri de dahil olmak üzere birçok darbeden kaçacak.
In Aralık 2001 , 13 paralı komando grubu tarafından yenildi Ulusal Kalkınma Ordusu saflarında yaralı sadece biriyle.
In 2002 , Moheli yeni anayasanın anlaşmasını onayladı Komorlar Birliği , adaların özerklik yaprakları daha odaya ancak seçimler gerçekleşemez. Durum, özellikle Anjouan'daki güç istikrarlı olmadığı için engellenmiş görünüyor . O zamandan beri, küçük Mohéli liderleri, iki büyük ada arasındaki yerlerini, bunların bakış açılarını birbirine yaklaştırmaya çalışarak bulmaya çalışıyorlar.
Albay Azali Assoumani , Nisan 1999'da bir darbe yaptı ve iktidara geldi. Ağır özellikle himayesinde, uluslararası toplum tarafından eleştirilen Afrika Birliği ve Thabo Mbeki Güney Afrika başkanı olduğu independentist ile diyaloğu sürdürme Mohamed Bacar . Albay Azali, başarısızlıkla Antananarivo anlaşmalarını uygulamaya çalışır , ancak Anjouan yetkilileri yine de reddeder. Anjouanlılar da 23 Ocak 2000'de düzenlenen istişarede, bağımsız bir devlete sahip olma isteklerini göstermeyi tercih ederek ezici bir çoğunlukla reddettiler. Prensipte herhangi bir sınır değişikliğine karşı çıkan AU, 21 Mart 2000 tarihinden itibaren yakıtlar, gıda maddeleri, deniz ve hava iletişiminin yanı sıra telekomünikasyona süresiz bir ambargo emri verdi. Abluka, daha sonra çok sayıda Mayotte'ye taşınan Anjouanlar için hayatı çok zorlaştırdı. 24 Ağustos 2000'de Anjouan lideri Albay Azali ve Yarbay Saïd Abeid Abdéramane yeni bir anlaşmanın ilkelerini, " Fomboni Bildirisi " ni belirlediler . Bu anlaşma, eski devletin ortadan kalkmasına karşı çıkan ve Anjouan'a yönelik yaptırımları sürdüren AU'yu tatmin etmiyor. Komor ortaklarının oturduğu bir izleme komitesi oluşturuldu; UA, OIF … Anjouan'a yönelik yaptırımlar kaldırıldı.