Genetik işaretleyici

Genetik markör a, gen ya da polimorfik DNA sekansı, bir üzerindeki bilinen bir yere kolayca tespit edilebilir kromozom . Genomu "etiketlemek" ve bireyleri veya türleri tanımlamak için genetik haritalamada kullanılabilir .

Genetik markör, gözlemlenebilen bir varyasyon ( genomik lokusların mutasyonu veya değişmesine bağlı olarak meydana gelebilir ) olarak tanımlanabilir. Bir genetik işaretleyici, tek bir baz çifti etrafındaki bir dizi (tek nükleotid polimorfizmi, SNP ) gibi kısa bir DNA dizisi veya minisatellitler gibi tekrarlanan diziler ( VNTR ) olabilir .

1980 yılına kadar , genetik belirteçler morfolojikti çünkü bunlar yalnızca fenotiplerin analizinden haritalanan polimorfik genlere dayanıyordu . Yeni biyoteknolojiler ( PCR, vb.) , Bir genetik harita ( moleküler belirteçler - doğrudan DNA - veya biyokimyasal) oluşturmak için DNA dizilerinin polimorfizminin doğrudan analizine izin verir .

İşaretçi türleri

Farklı tür işaretçiler vardır:

• RFLP , Restriction Fragment Length Polymorphism,
• AFLP , Yükseltilmiş Parça Uzunluğu Polimorfizmi
• SSLP , Basit sıra uzunluğu polimorfizmi
• RAPD , Polimorfik DNA'nın Rastgele Amplifikasyonu
• SNP , Nükleotid Polimorfizmi,
• SSCP , Tek sarmallı yapısal polimorfizm
• EST , Eksprese Sıra Markörü,
• CNV , Kopya sayısının değişkenliği,
• VNTR , Tekrarlanan dizi
  • SSR (basit dizi tekrarı) veya Mikrosatellit polimorfizmi ,
  • minisatellit ,
  • STS , Sıra etiketli site

Özellikler

Bretting ve Widrlechner'e (1995) göre, bir genetik belirteç için ideal koşullar şunlardır:

• olmak polimorfik kolayca bireyler veya soyları arasında ayrım yapabilmek amacıyla;
• hem incelenen özelliğin değeri hem de seçici değer açısından nispeten "tarafsız" olabilir  ;
• olmak codominant ayırt, heterozigot gelen homozigotların  ;
• basit kalıtsal bir Mendel özelliği ;
• pleiotropik veya epistatik olmamalıdır  ;
• genom boyunca dağılmış olmak;
• başka bir işaretleyiciye bağlı olmamalıdır;
• gelişim aşamasından bağımsız olarak istikrarlı olun;
• büyüme veya cinsel üreme üzerinde herhangi bir etkisi yoktur;
• olası belirsizlik olmadan kolaylıkla gözlemlenebilir;
• ucuz olmak;

Markörlerin sınıflandırılması

İfşa edip etmediklerine bağlı olarak üç gruba ayrılabilirler:

• kodominantlık veya dominant alel
• dizilerin veya tekrar birimlerinin polimorfizmi
• bir lokus , belirli bir bölge veya tüm bölgeler ( genetik profil , doymuş genetik haritalar ).

Notlar ve referanslar

1. Daniel Prat ve diğerleri, Genom analizi ve orman genetik kaynaklarının yönetimi [ çevrimiçi okuyun ] , s. 73-74, ed. Quae, 2006, 456 s. ( ISBN  2738012272 ) .
2. D. De Vienne ve S. Santoni , "  Moleküler belirteçlerin ana kaynakları  ", Genetikte moleküler belirteçler ,1998, s.  49-79

Kafam karışmasın

• Genetik dönüşüm için kontrol görevi gören markör geni ,
• Biyolojik işaret , ekolojik rahatsızlıklara tanıklık,