NCK2
NCK2 sitoplamik protein
|
3D modelleme ve NCK2
proteini |
Ana Özellikler |
---|
|
Onaylanmış ad
|
Sitoplazmik protein NCK2 Adaptör protein NCK 2 Büyüme Faktörü Reseptöre Bağlı Protein 4 Adaptör protein SH2 / SH3 NCK-Beta
|
---|
Sembol
|
O43639-NCK2_ İNSAN
|
---|
Eş anlamlı
|
Grb4
|
---|
Fonksiyon
|
Adaptör
|
---|
İnsan |
---|
|
Yer yer
|
2 q12,2 105.894.274
|
---|
yer
|
105.744.648
|
---|
İzoelektrik noktası
|
6.49 |
---|
Moleküler ağırlık
|
42 915 Da
|
---|
Kalıntı sayısı
|
380 amino asit
|
---|
|
İçeri gel
|
8840
|
---|
HUGO
|
7665
|
---|
OMIM
|
604930
|
---|
UniProt
|
O43639
|
---|
RefSeq ( mRNA )
|
NC_000002.12 , NC_018913.2
|
---|
RefSeq ( protein )
|
NP_001004720.1 , NP_001004722.1 , NP_003572.2 , XP_006712860.1 , XP_011510293.1 , XP_011510294.2 , XP_016860592.1 , XP_016860593.1 , XP_016860594.1
|
---|
|
Birlikte
|
ENSG00000071051
|
---|
PDB
|
4E6R , 2CIA , 1WX6 , 2B86 , 2JXB , 1U5S , 2FRY , 1Z3K , 2FRW
|
---|
|
|
Sitoplazmik protein NCK2 olarak da bilinen, NCK-beta ve Grb4 , insanlarda bir proteindir kodlanan ile NCK2 geni .
Açıklama ve işlev
NCK , adaptör proteinleri ailesine aittir , memelilerde NCK1 ve NCK2 olmak üzere iki NCK geni vardır . İnsan türünde NCK1, kromozom 3'te ve NCK2, kromozom 2'de bulunur . Protein, üç alan SH3 (in) ve bir SH2 alanından (in) oluşur . Proteinin bilinen katalitik bir işlevi yoktur . Bununla birlikte, reseptör protein tirozin kinazların düzenlenmesinde rol oynayan çeşitli proteinlerle ilişkili olduğu ve bunları topladığı gösterilmiştir . Bu düzenleyici eylemler sayesinde, bu proteinin hücre iskeletinin yeniden düzenlenmesinde rol oynadığına inanılıyor . Ek olarak, bu sitoplazmik adaptör üzerinde farklı izoform benzeri proteinleri kodlayan alternatif ekleme ve transkripsiyon varyantları tanımlanmıştır.
Çıkarımlar ve etkileşimler
Özellikle NCK2'nin aşağıdakilerle etkileşime girebileceği belirlenmiştir:
Notlar ve referanslar
Notlar
Referanslar
-
(in) " UniProtKB - O43639 (NCK2_HUMAN) " üzerine site "Unıprot" (erişilen Haziran 2017 16 ) .
-
(inç) " NCK2 (insan) " , " Phosphosite " sitesinde ( 16 Haziran 2017'de erişildi ) .
-
(in) " UCSC Genome Browser on Human Dec. 2013 (GRCh38 / hg38) Assembly " , GenomeUcscEdu sitesinde (erişim 15 Haziran 2017 ) .
-
kütle için değerleri ve kalıntılarının sayısını burada belirtilen olanlardır protein öncüsünün elde edilen çeviri bölgesinin gen önce, post-translasyonel modifikasyonlar , ve karşılık gelen değerlerden önemli ölçüde farklı olabilir fonksiyonel protein .
-
M. Chen , H. She , EM Davis , CM Spicer vd. , " Nck ailesi genlerinin belirlenmesi, kromozomal lokalizasyon, ifade ve sinyal özgüllüğü ", The Journal of Biological Chemistry , cilt. 273, n o 39,Eylül 1998, s. 25171–8 ( PMID 9737977 , DOI 10.1074 / jbc.273.39.25171 ).
-
(in) THE Braverman ve LA Quilliam , " Identification of Grb4 / Nckbeta, bir src homoloji 2 ve 3 alan içeren protein, Nck'ye benzer bağlanma ve biyolojik özelliklere SAHİP OLAN " , The Journal of Biological Chemistry , cilt. 274, n o 9,Şubat 1999, s. 5542–9 ( PMID 10026169 , DOI 10.1074 / jbc.274.9.5542 )
-
(inç) Liu J, Li Bay Ran X., Fan JS ve J. Song, " Bağlanma çeşitliliği girdilerinin NCK2 insan SH3 alanları ve prolin bakımından zengin proteinlere ilişkin yapısal içgörü " , Biochemistry , cilt. 45, n o 23,Haziran 2006, s. 7171–84 ( PMID 16752908 , DOI 10.1021 / bi060091y ).
-
(en) " Gene Code: NCK2 NCK adapter protein 2 " , Ncbi web sitesinde ( 15 Haziran 2017'de erişildi ) .
-
(in) Y Tu , F. Li , S. Goicoechea ve C. Wu , " Yalnızca LIM proteini PINCH, integrin bağlantılı kinaz ile Doğrudan Etkileşir ve hücrelerin yayılmasında integrin açısından zengin web sitelerinde görev alır veya bunlara dahil edilir " , Moleküler ve Hücresel Biyoloji , cilt. 19, n o 3,Mart 1999, s. 2425–34 ( PMID 10022929 , PMCID 84035 , DOI 10.1128 / mcb.19.3.2425 ).
-
(in) Y Tu , F. Li ve C. Wu , " Nck-2, sadece LIM proteini PINCH ve büyüme faktörü reseptör kinaz sinyal yollarının bileşenleri ile Etkileşen yeni bir Src homolojisi2 / 3 içeren adaptör protein " , Hücrenin Moleküler Biyolojisi , cilt. 9, n o 12,Aralık 1998, s. 3367–82 ( PMID 9843575 , PMCID 25640 , DOI 10.1091 / mbc.9.12.3367 ).
-
(inç) Chen M. , She H. , A. Kim vd. , " Nckbeta adaptörü, trombosit kaynaklı büyüme faktörü bb'ye yanıt olarak NIH 3T3 fibroblastlarda aktin polimerizasyonunu düzenler " , Molecular and Cellular Biology , cilt. 20, n o 21,Kasım 2000, s. 7867–80 ( PMID 11027258 , PMCID 86398 , DOI 10.1128 / mcb.20.21.7867-7880.2000 ).
-
(inç) SM Goicoechea , Y. You , Y. Hua vd. , " Nck-2 fokal yapışma kinaz ile etkileşir ve hücre hareketliliğini modüle eder " , The International Journal of Biochemistry & Cell Biology , cilt. 34, n o 7,Temmuz 2002, s. 791–805 ( PMID 11950595 , DOI 10.1016 / s1357-2725 (02) 00002-x ).
-
(in) D. Gil , WW Schamel , Mr. Montoya , F. Sánchez-Madrid ve B. Alarcon , " Nck'nin CD3 epsilon tarafından işe alınması T hücre reseptör sinyali ve sinaps oluşumu için gerekli olan ligand kaynaklı konformasyonel değişiklikleri ortaya koyuyor " , Hücre , cilt. 109, n o 7,Haziran 2002, s. 901–12 ( PMID 12110186 , DOI 10.1016 / S0092-8674 (02) 00799-7 ).
-
(in) S. Suzuki , Mr. Mizutani , Suzuki K. , M. Yamada vd. , " Beyin kaynaklı nörotrofik faktör, Nck2 adaptör proteininin TrkB tirozin kinaz reseptörü ile etkileşimini teşvik eder " , Biyokimyasal ve Biyofiziksel Araştırma İletişimi , cilt. 294, n o 5,Haziran 2002, s. 1087–92 ( PMID 12074588 , DOI 10.1016 / S0006-291X (02) 00606-X ).
-
(inç) Dominique Bagnard Axon Büyüme ve Rehberlik , Springer Science & Business Media, 10 Aralık 2008, 170 s. ( çevrimiçi okuyun ) , sayfalar 32-40.
-
Alexandre Moreau, “III. Uyarıcı sinaptik iletimin modülasyonunda Nck2 / PAK3 etkileşiminin rolü: görsel kortekste uyarma-inhibisyon dengesinin serotonerjik kontrolü. » , Alexandre Moreau, Sinir ağlarının nöromodülasyonu , Paris-Sud Üniversitesi,2009( çevrimiçi okuyun [PDF] ) , sayfalar 157-180.
Daha derine gitmek için
Kaynakça
-
(tr) Dominique Bagnard, Axon Growth and Guidance , Springer Science & Business Media, 10 Aralık 2008, 170 s. ( çevrimiçi okuyun ) , sayfalar 32-40.
-
Alexandre Moreau, “III. Uyarıcı sinaptik iletimin modülasyonunda Nck2 / PAK3 etkileşiminin rolü: görsel kortekste uyarma-inhibisyon dengesinin serotonerjik kontrolü. » , Alexandre Moreau, Sinir ağlarının nöromodülasyonu , Paris-Sud Üniversitesi,2009( çevrimiçi okuyun [PDF] ) , sayfalar 157-180.
-
(en) N. Xu ve M. Henkemeyer , " Grb4 ve sitoskeletal düzenleyiciler aracılığıyla Ephrin-B3 ters sinyal iletimi akson budamasına aracılık eder " , Nature Neuroscience , cilt. 12,2009, s. 268–276 ( PMID 19182796 , PMCID 2661084 , DOI 10.1038 / nn.2254 ).
-
(en) Lei Shi , " Beyin gelişimi ve nörolojik hastalıkta Dock protein ailesi " , İletişimsel ve Bütünleştirici Biyoloji , cilt. 6, n o 6,1 st Kasım 2013( DOI 10.4161 / cib.26839 , çevrimiçi okuma , 13 Haziran 2017'de erişildi ).
-
(tr) Li W, Hu P, Skolnik EY vd. , " SH2 ve SH3 alanını içeren Nck proteini onkojeniktir ve farklı yüzey reseptörleri tarafından fosforilasyon için ortak bir hedeftir " , Molecular and Cellular Biology , cilt. 12, n o 12,Aralık 1992, s. 5824–33 ( PMID 1333047 , PMCID 360522 , DOI 10.1128 / MCB.12.12.5824 ).
-
(en) Tu Y, Li F ve Wu C, " Nck-2, sadece LIM proteini PINCH ve büyüme faktörü reseptör kinaz sinyal yollarının bileşenleri ile etkileşime giren yeni bir Src homolojisi2 / 3 içeren adaptör protein " , Moleküler Biyoloji of the Cell , cilt. 9, n o 12,Aralık 1998, s. 3367–82 ( PMID 9843575 , PMCID 25640 , DOI 10.1091 / mbc.9.12.3367 ).
-
(en) Tu Y, Li F, Goicoechea S ve Wu C, " Yalnızca LIM proteini olan PINCH, integrin bağlantılı kinaz ile doğrudan etkileşime girer ve yayılan hücrelerde integrin açısından zengin bölgelere alınır " , Molecular and Cellular Biology , cilt. 19, n o 3,Mart 1999, s. 2425–34 ( PMID 10022929 , PMCID 84035 , DOI 10.1128 / mcb.19.3.2425 ).
-
(en) Braverman LE ve Quilliam LA, " Identification of Grb4 / Nckbeta, bir src homoloji 2 ve 3 alan içeren adaptör protein, Nck'ye benzer bağlanma ve biyolojik özelliklere sahip " , The Journal of Biological Chemistry , cilt. 274, n o 9,Şubat 1999, s. 5542–9 ( PMID 10026169 , DOI 10.1074 / jbc.274.9.5542 ).
-
(en) Coutinho S, T Jahn, Lewitzky M vd. , " Bcr-Abl ile etkileşime giren bir adaptör protein olan Ggrb4'ün karakterizasyonu " , Blood , cilt. 96, n o 2temmuz 2000, s. 618–24 ( PMID 10887126 ).
-
(en) Chen M, She H, Kim A, Woodley DT ve Li W, " Nckbeta adaptörü trombosit kaynaklı büyüme faktörü bb'ye yanıt olarak NIH 3T3 fibroblastlarda aktin polimerizasyonunu düzenler " , Molecular and Cellular Biology , cilt. 20, n o 21,Kasım 2000, s. 7867–80 ( PMID 11027258 , PMCID 86398 , DOI 10.1128 / MCB.20.21.7867-7880.2000 ).
-
(tr) Tu Y, Kucik DF ve Wu C, " Nck-2 ve DOCK180 arasındaki etkileşimin tanımlanması ve kinetik analizi " , FEBS Mektupları , cilt. 491, n o 3,Mart 2001, s. 193–9 ( PMID 11240126 , DOI 10.1016 / S0014-5793 (01) 02195-0 ).
-
(tr) Jahn T, Seipel P, Coutinho S, Miething C ve diğerleri. , " Grb4 / Nckbeta, c-jun / c-fos promoter elementlerinden v-Abl ile indüklenen transkripsiyonun nükleer baskılayıcısı olarak görev yapar " , The Journal of Biological Chemistry , cilt. 276, n o 46,Kasım 2001, s. 43419–27 ( PMID 11514578 , DOI 10.1074 / jbc.M107030200 ).
-
(tr) Cowan CA ve Henkemeyer M, " SH2 / SH3 adaptörü Grb4, B-ephrin ters sinyallerini dönüştürür " , Nature , cilt. 413, n o 6852,Eylül 2001, s. 174–9 ( PMID 11557983 , DOI 10.1038 / 35093123 ).
-
(en) Goicoechea SM, Tu Y, Hua Y vd. , " Nck-2 fokal yapışma kinaz ile etkileşir ve hücre hareketliliğini modüle eder " , The International Journal of Biochemistry & Cell Biology , cilt. 34, n o 7,Temmuz 2002, s. 791–805 ( PMID 11950595 , DOI 10.1016 / S1357-2725 (02) 00002-X ).
-
(en) Suzuki S, Mizutani M, Suzuki K vd. , " Beyin kaynaklı nörotrofik faktör, Nck2 adaptör proteininin TrkB tirozin kinaz reseptörü ile etkileşimini teşvik eder " , Biyokimyasal ve Biyofiziksel Araştırma İletişimi , cilt. 294, n o 5,Haziran 2002, s. 1087–92 ( PMID 12074588 , DOI 10.1016 / S0006-291X (02) 00606-X ).
-
(en) Gil D, Schamel WW, Montoya M vd. , " CD3 epsilon tarafından Nck alımı, T hücresi reseptör sinyallemesi ve sinaps oluşumu için gerekli olan ligand kaynaklı konformasyonel bir değişikliği ortaya çıkarır " , Cell , cilt. 109, n o 7,Haziran 2002, s. 901–12 ( PMID 12110186 , DOI 10.1016 / S0092-8674 (02) 00799-7 ).
-
(tr) Song J, Vranken W, Xu P ve diğerleri. , " İki yönlü sinyalleşme özelliklerine sahip bir hücre yüzeyi ligandı olan insan ephrin B2'nin fonksiyonel sitoplazmik alt alanının çözüm yapısı ve omurga dinamikleri " , Biochemistry , cilt. 41, n o 36,Eylül 2002, s. 10942–9 ( PMID 12206665 , DOI 10.1021 / bi025815u ).
-
(en) Aspenström P, " WASP bağlayıcı protein WIRE, trombositten türetilmiş büyüme faktörü reseptörünün aşağı akışındaki aktin filaman sisteminin düzenlenmesinde bir role sahiptir " , Experimental Cell Research , cilt. 279, n o 1,Eylül 2002, s. 21–33 ( PMID 12213210 , DOI 10.1006 / excr.2002.5576 ).
- (en) S. Hafizi , F. Alindri , R. Karlsson ve B. Dahlbäck , " Axl reseptör tirozin kinazın, tensine homolojiye sahip yeni bir C1 alan içeren protein olan C1-TEN ile etkileşimi " , Biyokimyasal ve Biyofiziksel Araştırma İletişimi , uçuş. 299, n o 5,Aralık 2002, s. 793–800 ( PMID 12470648 , DOI 10.1016 / S0006-291X (02) 02718-3 )
-
(tr) Velyvis A, Vaynberg J, Yang Y vd. , " PINCH LIM4 etki alanı aracılı integrin sinyalleşmesine ilişkin yapısal ve işlevsel içgörüler " , Nature Structural Biology , cilt. 10, n o 7,Temmuz 2003, s. 558–64 ( PMID 12794636 , DOI 10.1038 / nsb938 ).
-
(en) Ran X ve Song J, " Tyr-fosforile insan efrinB'leri ve Nck2 SH2 alanı arasındaki bağlanma çeşitliliğine ilişkin yapısal anlayış " , The Journal of Biological Chemistry , cilt. 280, n o 19,Mayıs 2005, s. 19205–12 ( PMID 15764601 , DOI 10.1074 / jbc.M500330200 ).
-
(en) Song J, " Ters sinyalleşme için iyi paketlenmiş ephrinB sitoplazmik beta-firketesinin tirozin fosforilasyonu: Yapısal sonuçlar ve bağlanma özellikleri " , The Journal of Biological Chemistry , cilt. 278, n o 27,Temmuz 2003, s. 24714–20 ( PMID 12606549 , DOI 10.1074 / jbc.M210625200 ).
Dış bağlantılar
İlgili Makaleler