Thanatotranscriptome

Thanatotranscriptome (alanlarında tayin biyokimya , mikrobiyoloji ve biyofizik hatta tanatoloji ve özellikle Adli tıp ) tüm RNA'lar kısmının transkripsiyonundan sonuçlanan bir genom hala etkin sırasında veya organlarda bir kadavra iç organlarını uyandırdı ölüm zamanını izleyen 24 ila 48 saat (Yakın zamanda, bu 48 saat içinde genlerin bir kısmının hücrelerde ifade edilmeye devam ettiği , mRNA ürettiği ve bazı genlerin sondan beri inhibe edildiklerinde tekrar ifade edildiği gösterilmiştir. fetal yaşam).

Thanatotranscriptomic analiz

Bu, bir gelen olabilir ölüm sonrası seroloji, karakterize transkriptom a , özellikle doku , bir hücre tipinin, ya da farklı deneysel koşullar arasında transcriptomes karşılaştırın.

Ölümü takip eden günlerde nekromasın dönüşüm süreçlerini daha iyi anlamak, thanatomicrobiome analizini tamamlayıcı olabilir .

Karakterizasyonu ve belirli bir "ölü" dokusunda ve belirli koşullar altında transcriptome ölçümü mümkün tespit etmek hale aktif genlerin düzenleme mekanizmaları belirlemek için, gen ekspresyonu ve gen ekspresyonu ağları tanımlamak için kullanılır.

Analitik teknikler

Çok sayıda farklı tipte haberci RNA'nın konsantrasyonunu eşzamanlı olarak ölçmek için yaygın olarak kullanılan teknikler , RNA-Seq olarak bilinen yüksek verimli RNA dizilemesi olan mikrodizileri içerir .

Bilimsel tarih

Bir transkriptom postmortem varlığına ipuçları başından bu yana en az var XXI inci yüzyılın ama içinde bilimsel literatürde kelimesi thanatotranscriptome ilk Javan ark önerilmiştir görünüyor. 2015 yılında;

At Washington Üniversitesi , Peter Noble, son zamanlarda Alex Pozhitkov ve meslektaşları (2016) fareler zebra zehirlerin ölümden sonra 2 gün (48 saat) o kadar doğruladı, birçok genler kendi içinde çalışmaya devam cesetlerin. . Cesetteki haberci RNA
miktarındaki farklılıklar, çok farklı işlevlere sahip yüzlerce genin ölümden hemen sonra uyandığını kanıtlıyor: Böylece zebra balığı ölümünden sonra 548 , laboratuar farelerinde 515 gen uyandı . Bu şekilde uyan genler arasında, normal olarak sadece aktif genler de dahil olmak üzere bir organizma, gelişmesinde rol oynayan genler uterusta veya ovo cenin gelişimi sırasında (yumurtada).

Bahisler

Bu bilgiler belki gelecekte şunları yapmayı mümkün kılabilir:

" ölüm " olgusunun hem daha kesin hem de daha nüanslı bir tanımını oluşturmak ;
Adli patologun (veya örneğin bir zoonoz durumunda, zehirlenmenin zamanları veya nedenleri hakkında bilgi gerektiren bir eko-epidemiyolojik araştırma sırasında bir biyolog veya bir veteriner tarafından) ölüm zamanını daha iyi belirtin . Bundan çok uzağız, ancak bu fenomenin insanlarda aşamalarını daha iyi anlayabilirsek, adli bir patolog belki de gelecekte bir "ölüm sonrası seroloji" yoluyla , mRNA'nın dozajına göre, çok daha hassas bir şekilde tespit edebilir. ölümden bu yana geçen süre (günler yerine saatler veya hatta dakikalar olarak, bu ölüm koşullarını yeniden kurmayı amaçlayan araştırmalar için yararlı olabilir).
Hücre ölümü , apoptoz veya organ ölümü fenomenine ve özellikle iskemi ( özellikle miyokardiyal ) fenomeni ve iyileşme veya esneklik süreçlerine ışık tutabilir , böylece belki daha sonra bunları kolaylaştırabilir.
Genlerin bu uyanışı, aynı zamanda, bu hayvanların ölümünden sonra 48 saate kadar hücrelerde hücresel mekanizmanın aktivasyonu için yeterli enerji kaldığını da gösterir. Bu genlerin en azından bir kısmının, fizyolojik iyileşme, yara izi veya "kendi kendine canlandırma" süreçlerinde yer alan genler olduğu görülmektedir.
kanseri daha iyi anlayın. Ölümden hemen sonra yeniden aktive olan genler arasında bazılarının kanserleşme sürecine dahil olan genler olduğu bulundu (ölümden yaklaşık 24 saat sonra ulaşılan bir aktivite zirvesi ile yeniden aktive edildi); Bu fenomenin ayrıntılı bir şekilde anlaşılması, kanserojenleşme fenomenine ışık tutabilir ve belki de onunla daha iyi mücadele için bazı yeni unsurlar getirebilir.
organ nakillerinin kalitesini iyileştirir. Nitekim hayvanlarda kanserle ilişkili genlerin ölümden sonra aktive olması gerçeği, bu nakilleri alan kişilerde kanser görülme sıklığını azaltmak için bizi organ naklindeki gecikmeleri dikkate almaya davet eden bir bilgidir. Yeni bir karaciğer nakli geçirmiş kişiler aslında tedaviden sonra istatistiksel olarak normalden daha fazla kansere sahip olurlar. Bu fenomen, kendilerine uygulanan diyete veya vücutlarının nakli reddetmemesi için aldıkları immünosupresif ilaçlara atfedildi. (Henüz doğrulanacak) bir hipotez aktive kanser genleri olan bir donörün karaciğer de rol oynayabilir.
aynı şeyin insanlarda da doğru olup olmadığını öğrenin, çünkü önceki çalışmalar travma, kalp krizi veya boğulma nedeniyle ölen insanlarda, kalp kası kasılması ve yara iyileşmesi dahil olmak üzere çeşitli genlerin ölümden 12 saat sonra aktif olduğunu göstermiştir. . Aynısı diş pulpasının genleri için de geçerlidir. 2015 yılında bazı yazarlar “ apoptotik thanatotranscriptome ” kavramını tanıttı ;
Başka bir hipotezi test etmek, ölümden sonra, "baskılayıcı genlerin" aktivitesinde hızlı bir düşüşün (normalde fetal aşamadan sonra işe yaramaz hale gelenler de dahil olmak üzere diğer genlerin aktivasyonunu inhibe eder) uyku genlerinin uyanmasına izin vereceğini, en azından bu kısa süre için.

Ayrıca görün

Referanslar

Pozhitkov, AE, Neme, R., Domazet-Loso, T., Leroux, B., Soni, S., Tautz, D. ve Noble, PA (2016). Thanatotranscriptome: organizma ölümünden sonra aktif olarak ifade edilen genler. bioRxiv, 058305.
Javan, GT, Can, I., Finley, SJ ve Soni, S. (2015). Kadavra karaciğeri ile ilişkili apoptotik thanatotranscriptome. Adli bilim, tıp ve patoloji, 11 (4), 509-516 ( özet .
Williams, Anna (2016) “ Ölümden iki gün sonra hayata kıvılcım saçan yüzlerce gen (Birçok genin ölümden 48 saat sonrasına kadar hala çalıştığının keşfi, organ nakilleri, adli tıp ve bizim ölüm tanımımız) ”; New Scientist, 21 Haziran 2016, BioRxiv, DOI: 10.1101 / 058305 tarafından atıfta bulunulan “ Genler öldükten sonra aktifleşiyor ” başlıklı bir makale hakkında yorum yapıyor; DOI: 10.1101 / 058370
Javan, GT, Finley, SJ, Abidin, Z., & Mulle, JG (2016) o Thanatomicrobiome: A Missing Piece of the Microbial Puzzle of Death . Mikrobiyolojide sınırlar, 7
Javan, GT, Can, I., Finley, SJ ve Soni, S. (2015). Kadavra karaciğeri ile ilişkili apoptotik thanatotranscriptome . Adli bilim, tıp ve patoloji, 11 (4), 509-516.
Javan, GT, Kwon, I., Finley, SJ ve Lee, Y. (2015). Biyokimya ve Biyofizik Raporları .
Moreno, LI, Tate, CM, Knott, EL, McDaniel, JE, Rogers, SS, Koons, BW, ... & Robertson, JM (2012). Adli uygulamalar için mRNA miktarının belirlenmesi için etkili bir temizlik geninin belirlenmesi. Adli bilimler Dergisi, 57 (4), 1051-1058 ( özet ).
González-Herrera, L., Valenzuela, A., Marchal, JA, Lorente, JA ve Villanueva, E. (2013). İnsan miyokard dokusunda, perikard sıvısında ve kanında RNA bütünlüğü ve gen ekspresyonu ve bunun postmortem stabilitesi üzerine çalışmalar. Adli bilimler uluslararası, 232 (1), 218-228 ( özet ).
Poór, VS, Lukács, D., Nagy, T., Rácz, E. ve Sipos, K. (2016). İnsan diş pulpasındaki RNA degradasyon hızı, post-mortem aralığı ortaya çıkarır. Uluslararası hukuk tıbbı dergisi, 130 (3), 615-619 ( özet ).

İlgili Makaleler

Dış bağlantılar

Kaynakça

Javan, GT, Can, I., Finley, SJ ve Soni, S. (2015). Kadavra karaciğeri ile ilişkili apoptotik thanatotranscriptome . Adli bilim, tıp ve patoloji, 11 (4), 509-516.
Javan, GT, Kwon, I., Finley, SJ ve Lee, Y. (2016). Kadavra beyin ve kalp dokularında tanatofajinin ilerlemesi . Biyokimya ve Biyofizik Raporları, 5, 152-159.
Pozhitkov, AE, Neme, R., Domazet-Loso, T., Leroux, B., Soni, S., Tautz, D. ve Noble, PA (2016). Thanatotranscriptome: organizma ölümünden sonra aktif olarak ifade edilen genler . bioRxiv, 058305.