Kısaltması ATAC-seq gelen İngiliz A için ssay T ransposase- A ccessible C hromatin ile highthroughput seq uencing . Bu, moleküler biyolojide kromatinin erişilebilir bölgelerini ve daha az ölçüde etraflarındaki nükleozomal konumlanmayı karakterize etmek için kullanılan bir tekniktir . Bu yöntem ilk olarak 2013 yılında tanımlanmıştır.
ATAC-seq ilkesi, Tn5 transpozazının numunenin genomik DNA'sı üzerindeki etki şekline dayanır . Transpozazlar, transpozonların genomun diğer kısımlarına hareketini katalize eden enzimlerdir . Doğal transpozazlar düşük seviyede aktiviteye sahip olmasına rağmen, ATAC-seq aşırı aktif mutasyona uğramış bir transposaz kullanır.
Transpozonlar, tercihen nükleozomlardan yoksun genomik bölgelere dahil edilir ( İngilizce nükleozom içermeyen bölgeler ). Bu nedenle, genomun belirli lokuslarının sekanslarının zenginleşmesi, nükleozomların veya diğer DNA-protein etkileşimlerinin olmadığını gösterir.
ATAC-seq'in avantajları şunları içerir: