MNase-Sekans kullanılan bir tekniktir , moleküler biyoloji bölgelerini tanımlamak için kromatin tarafından işgal nükleozomlar boyunca genomu .
Bu teknik, MNase ile sindirimden kaynaklanan parçaların yüksek verimli dizilişine dayanmaktadır . Kromatinin MNase tarafından sindirilmesi, bir veya daha fazla nükleozom tarafından işgal edilen DNA bölgelerinin tanımlanmasını mümkün kılan nispeten basit ve etkili bir yöntemdir . Geçirgenleştirilmiş hücrelerin çekirdekleri, iki değerlikli bir katyon (örneğin Ca2 + ) varlığında MNase'ye maruz bırakıldığında , bu nükleaz, yandaki şekilde gösterildiği gibi nükleozomlar arasında çift sarmallı kesikler yapar. Kromatin substratlarının çok yüksek MNaz konsantrasyonları ile muamelesi, mononükleozomların çoğunu üretir. Jel üzerinde göç ve ardından 146 baz çifti (bp) civarında bir kesim , mononükleozomların büyük bir çoğunluğunun elde edilmesini sağlamayı mümkün kılar. Bu işlemden kaynaklanan fragmanlar daha sonra çeşitli yüksek verimli sıralama protokollerine göre sıralanır.
MNase-Seq verilerinin temel işlenmesi ChIP-Seq , DNase-Seq ve FAIRE-Seq ile benzerdir , ancak fragmanların gerçek boyutunu yansıtmak için genellikle tam olarak 146 bp'ye gerilir. 73 bp'lik bir okuma kaymasına dayanan diğer yöntemler, nükleozomal orta noktayı veya nükleozomların uçlarını, her iplik için herhangi bir uzama gerçekleştirmeyerek ve her okumanın başlangıç koordinatını kullanarak ( iplik).