Siklik di-guanozin monofosfat | |
Siklik di-guanozin monofosfatın yapısı |
|
Kimlik | |
---|---|
Eş anlamlı |
döngüsel di-GMP, |
N O CAS | |
PubChem | 124875 |
ChEBI | 49537 |
GÜLÜMSEME |
C1 [C@H] 2 [CH] ([C @ H] ([C@H] (O2) N3C = NC4 = C3NC (= NC4 = O) N) O) OP (= O ) (OCC5C ([C @ H] ([C @@ H] (O5) N6C = NC7 = C6NC (= NC7 = O) N) O) OP (= O) (O1) O) O , |
InChI |
Std. InChI: InChI = 1S / C20H24N10O14P2 / c21-19-25-13-7 (15 (33) 27-19) 23-3-29 (13) 17-9 (31) 11-5 (41-17) 1-39-45 (35,36) 44-12-6 (2-40-46 (37,38) 43-11) 42-18 (10 (12) 32) 30-4-24-8-14 (30) 26- 20 (22) 28-16 (8) 34 / h3-6.9-12.17-18.31-32H, 1-2H2, (H, 35.36) (H, 37.38) (H3,21,25,27,33) (H3, 22,26,28,34) / t5-, 6 ?, 9-, 10-, 11-, 12 ?, 17-, 18- / m1 / s1 Std. InChIKey: PKFDLKSEZWEFGL-WQKDRPCASA-N |
Kimyasal özellikler | |
Kaba formül |
C 20 H 24 N 10 O 14 P 2 [İzomerler] |
Molar kütle | 690.4107 ± 0.0239 g / mol C% 34.79, H% 3.5, N% 20.29, O% 32.44, P% 8.97, |
Aksi belirtilmedikçe SI ve STP birimleri . | |
Siklik di-GMP olarak da adlandırılan, bir siklik diguanylate , a, ikinci haberci birçok kişi tarafından kullanılan bakteri , ancak tarafından kullanılacak görünmüyor archaea ya göre ökaryotlar . Bu molekülün yapısı, iki nükleotid halkası oluşturan iki riboz-5-fosfat kalıntısı ile bağlanan iki guanin kalıntısına sahip küçük bir siklik RNA parçasıdır .
Bakterilerde, belirli sinyaller döngüsel di-GMP üreterek veya bozarak iletilir. Bu sentezlenir enzim olan diguanylate siklaz aktivitesi , proteinlerin bir olan Giy - Giy - Asp - Glu - Phe motifi , beş, bir dizi amino asidin bu proteinlerde korunmuş. Siklik di-GMP'nin bozunması, Glu - Ala - Leu veya His - Asp -Xxx- Gly - Tyr - Pro birimleri sergileyen fosfodiesterazlar tarafından gerçekleştirilir . Biyofilm oluşumu , hareketlilik , belirli hücre dışı polisakaritlerin üretimi ve mikropların virülansını belirleyen çok hücreli davranış , en azından belirli organizmalarda, özellikle siklik di-GMP tarafından modüle edildiği bilinen süreçlerdir.
Siklik di-GMP'nin hücre içi konsantrasyonu, farklı mekanizmalarla düzenlenir. Gly-Gly-Asp-Glu-Phe, Glu-Ala-Leu veya His-Asp-Xxx-Gly-Tyr-Pro karakteristik sekanslarını sergileyen birçok protein, NOT alanları gibi sinyalleri alabilen başka alanlara da sahiptir . Döngüsel di-GMP üreten veya parçalayan enzimler, hücrelerin belirli bölgelerine yerleşirler ve burada reseptörler üzerinde azaltılmış bir hacimde hareket ederler. Siklik di-GMP bir bir allosterik inhibitörü bazılarının diguanylate siklaz ve GDP selüloz sintaz arasında Gluconacetobacter xylinus . İkincisinde, siklik di-GMP, muhtemelen düzenleyici süreçte çok önemli olan, proteinin PilZ alanına bağlanır.
Son çalışmalar, iki bakteri türünün PilZ alanlarının yapısının, siklik di-GMP'ye bağlanarak konformasyonu tamamen değiştirdiğini ortaya koymuştur. Bu sonuçlar, PilZ alanlarının konformasyonel değişikliklerinin, siklik di-GMP'nin hedef enzimlerinin allosterik regülasyonunda belirleyici bir rol oynadığını güçlü bir şekilde ortaya koymaktadır.