Triptofanaz
Triptofanaz
E. coli triptofanazın ( PDB 4W1Y ) kristal yapısı
| EC No. | EC |
|---|---|
| CAS numarası | |
| Kofaktör (ler) | K + , PLP |
| IUBMB | IUBMB girişi |
|---|---|
| IntEnz | IntEnz görünümü |
| BRENDA | BRENDA girişi |
| KEGG | KEGG girişi |
| MetaCyc | Metabolik yol |
| PRIAM | Profil |
| PDB | Yapılar |
| GİT | AmiGO / EGO |
Gelen enzimoloji , bir triptofanaz a, liaz katalize kimyasal reaksiyon :
L- triptofan + H 2 O indol + piruvat + NH 3.
Bu enzim olan üretiminde yer alan indol ile deaminasyon ve triptofan , bir proteinogenik amino asidin .
Mikrobiyoloji
İndol üretimi, mikrobiyolojide bakterileri sınıflandırmak için kullanılan klasik reaksiyonlardan biridir.
Teknik
En çok kullanılan ortam, Üre-Triptofan olarak adlandırılması gereken "Urea-Indole" ortamıdır. Üre, triptofan, fenol kırmızısı ve su içerir. Üreaz varlığı, triptofan deaminaz (TDA) varlığı, triptofanaz varlığı olmak üzere üç araştırma için kullanılır . Steril su içinde bir süspansiyondan veya doğrudan katı besiyerindeki kolonilerden zengin bir şekilde aşılanır.
Yaklaşık 24 saatlik inkübasyondan sonra, reaktiflerin, indolün saptanması için Kovacs reaktifinin ve TDA'nın saptanması için demir III klorürün eklenmesinden önce üreazın doğrudan okunması gerçekleştirilir. Kovacs reaktifi, sudan daha az yoğun bir organik çözücü (pentan-1-ol) içinde çözelti halindedir: bu nedenle yüzeyde indol varlığında kırmızı olan ve aksi takdirde sarımsı kalan bir halka oluşturur.
Bir api20 E galerisinin kullanılması, Kovacs reaktifi veya James reaktifi ile indol üretiminin okunmasını da mümkün kılar. Ortam sadece triptofan içerir
Sonuçlar
Laktoz + Enterobacteriaceae arasında Escherichia coli en ünlü indol üreticisidir. Diğerleri onu Klebsiella oxytoca gibi üretir .
Notlar ve referanslar
- (in) A. Kogan, L. Raznov, NY Gdalevsky R. Cohen-Luria, O. Almog, AH Parola ve Y. Goldgur , " Holo holo ve 'yarı' formlarda Escherichia coli triptofanazın Yapıları ' , Acta Crystallographica Bölümü F , cilt. F71, n o Pt 3, 25760702 Mart 2015, s. 286-290 ( Bulunamayan PMCID 4356303 , DOI 10,1107 / S2053230X15000850 , çevrimiçi okuma )
- Jean-Noël Joffin ve Guy Leyral, Teknik mikrobiyoloji: Teknikler sözlüğü, Bordeaux, CANOPÉ ağı - CRDP d'Aquitaine,2014, 368 p. ( ISBN 978-2-86617-515-3 )