Nükleotid



Nükleotid hakkında toplayabildiğimiz bilgiler, mümkün olduğunca yararlı olması için dikkatlice kontrol edildi ve yapılandırıldı. Muhtemelen buraya Nükleotid hakkında daha fazla bilgi edinmek için geldiniz. İnternette, Nükleotid hakkında konuşan ve yine de Nükleotid hakkında bilmek istediklerinizi sunmayan sitelerin karmaşasında kaybolmak kolaydır. Aşağıdaki Nükleotid hakkında okuduklarınızı beğendiyseniz, yorumlarda bize bildireceğinizi umuyoruz. Nükleotid hakkında size sağladığımız bilgiler aradığınız şey değilse, bu siteyi her gün iyileştirebilmemiz için lütfen bize bildirin.

.

Bir nükleotid , bir nükleosid oluşturan pentoz adı verilen beş karbon atomlu bir ose ve son olarak bir ila üç fosfat grubundan oluşan bir nükleik asit bazından (veya azotlu baz ) oluşan organik bir moleküldür .

Adenosin trifosfat olarak adlandırılan, ATP , bir nükleotidi olduğu hidroliz şeklinde ADP ve fosfat bültenleri aktivitesi kullanılan bir miktar enerji hayvan hücresi  ; daha genel olarak dNTP ( ATP , GTP , CTP , UTP ) formunda nükleotidler metabolizmada merkezi bir rol oynar . Nükleotidler ayrıca hücre sinyallemesinde rol oynar . Bazıları biyokimyasal reaksiyonların kofaktörleri veya koenzimleridir .

Nükleotidler, DNA veya RNA gibi bir nükleik asidin yapı taşıdır .

Yapısı

Bir nükleotid üç bölümden oluşur:

  1. deoksiribozun 1 'karbon atomuna bağlanan nükleotid ( purin veya pirimidin ) tipine göre değişen bir nükleik baz ;
  2. beş karbon atomlu bir şeker ;
  3. deoksiribozun 5 'karbon atomuna (ve aşağıdaki nükleotidin deoksiribozun 3' karbon atomuna) bağlanan, DNA ve RNA nükleotidleri için özdeş bir fosfat (veya fosforik asit) grubu.

Şeker riboz ise ribonükleotidler veya şeker deoksiriboz ise deoksiribonükleotidler olarak adlandırılırlar.

Metabolik oluşum yolu

Pürin çekirdeklerinin biyosentezi  :
  - N 1gelen amin grubu arasında aspartik asit
  - Cı 2 ve C 8formattan türetilmiştir
  - N 3 ve N 9vardır amid grubu ve glutamin
  Cı - 4 , Cı- 5 ve N 7glisinden türetilmiştir
  - C 6türetilmiştir hidrojen karbonat (HCO 3 -).

İn vivo olarak, nükleotidler de novo sentezlenebilir veya geri dönüşüm yollarıyla geri dönüştürülebilir. Nükleotidler, yeni nükleotidler oluşturmak için sentetik reaksiyonlarda yararlı kısımların yeniden kullanılabilmesi için bozunmaya uğrar. Karaciğer, dört nükleotidin de novo sentezi için ana organdır.

De novo nükleotid sentezinde kullanılan bileşenler , karbonhidrat ve amino asit metabolizmasının biyosentetik öncülerinden ve ayrıca amonyak ve karbon dioksitten türetilir . Pirimidinlerin ve pürinlerin de novo sentezi iki farklı yol izler.

Referans olarak, purin ve pirimidin nükleotidlerinin sentezleri, belirli bir organel içinde değil, hücrenin sitoplazmasındaki birkaç enzim tarafından gerçekleştirilir.

DNA ve RNA'daki nükleotidler

Nükleotidler, DNA veya RNA gibi bir nükleik asidin yapı taşıdır . Bu iki tip sırasıyla üniform olarak deoksiriboz ve ribozdan oluşur , ancak nitrojenli baz değişkendir.

Şeker (veya ose , daha doğrusu burada pentoz ) DNA'da var olduğu, β- D -2'-Dezoksiriboz . "Deoksi" ön eki, bir hidroksil grubunun (-OH) eksik olduğu anlamına gelir . Aslında, tüm DNA bileşeni şekerlerin 2 pozisyonunda, hidroksi, bir ile değiştirildiği atomu arasında , hidrojen (H). Buna karşılık, hidroksil, ose'nin riboz olduğu RNA'da mevcut kalır .

Nükleotidler, fosfodiester bağları ile birbirine bağlanır . Bağlayıcı enzim olan DNA polimeraz DNA mevcut bir ipliği çiftleri DNA durumunda ve RNA polimeraz , bir RNA sarmalı bir., DNA model oluşturur RNA için.

Belirli bir nükleik asitte fosfatlar ve şekerler her zaman aynı olduğundan, nükleotidin doğası, içerdiği nükleik baz tarafından belirlenir. Bir DNA veya RNA sarmalının dizisi bu nedenle mevcut nükleik bazların ardışık olarak özetlenebilir. Beş ana nükleotid, nükleik tabanlarına göre adlandırılır.

RNA'da bulunan dört nükleik baz vardır: adenin, guanin, sitozin ve urasil. DNA, dört farklı nükleik baza karşılık gelen dört farklı deoksiribonükleotitten oluşur :

Tamamlayıcılıkla ikiye ikişer birleştirme özelliğine sahiptirler  :

  • İki hidrojen bağı kurarak TMP (timin) ile dAMP (adenin) ,
  • Üç hidrojen bağı kurarak dGMP (guanin) ile dCMP (sitozin).

RNA, dört farklı nükleik baza karşılık gelen dört farklı ribonükleotidden oluşur :

  • AMP , nükleobaz adenin (A),
  • GMP , nükleik asit baz guanindir (G),
  • UMP , nükleobaz olan urasil (U), bir pirimidin, sadece DNA görünür TMP yerine,
  • CMP , nükleobaz sitozin (C) 'dir.

UMP, adenozin monofosfat (AMP) ile eşleşir .

Sentetik biyoloji şekilde yapay nükleotidler oluşturur baz çifti ilk olarak bir doğal olmayan genişletilmiş genetik kodu  (in) .

ATP

Adenozin trifosfat veya ATP, canlı hücrelerde bir enerji depolama nükleotididir. Bu enerji, fosfat gruplarının hidrolizi ile açığa çıkar.

Nükleotid analogları

Olarak nükleozid analogları ile , bazı moleküllerin, bir nükleosid ve bir ya da daha fazla fosfat gruplarından oluşan, ilaç olarak sentezlenmiştir. Bu moleküller , HCV tedavisi için test edilen sofosbuvir içerir .

IUPAC kodları

IUPAC nükleik asit ve blok deoksiribonükleik nükleotitlerini temsil etmesi için aşağıdaki kodları tanımlanmıştır:

IUPAC kodu Nükleik temel
AT Adenin
VS Sitozin
G Guanin
T (veya U ) Timin (veya Urasil )
R A veya G
Y C veya T (U)
S G veya C
W A veya T (U)
K G veya T (U)
M A veya C
B C veya G veya T (U)
D A veya G veya T (U)
H A veya C veya T (U)
V A veya C veya G
DEĞİL Herhangi bir temel
. veya - boş

Notlar ve referanslar

  1. Deoksitimidin ve timidin terimleri eşanlamlıdır, böylece TMP, TDP ve TTP nükleotidleri deoksinükleotidlerdir , bunlara karşılık gelen ribonükleotidler 5-metilüridinler veya ribotimidinler , mono-, di- ve trifosfattır.
  1. Bolsover S., Hyams K, Shephard E, White H. & Wiedeman C. (2006). Moleküler ve Hücresel Biyoloji, Dunod.ed. 2 inci Baskı., Trans. Hücre Biyolojisi, kısa bir kurs, ikinci baskı, John, Wiley & Son Inc., bölüm 4.
  2. (in) Denis A. Malyshev, Kirandeep Dhami ve diğerleri, genişletilmiş bir genetik alfabeye sahip yarı sentetik organizma A  " , Nature , n o  509, ancak 15 2014, s.  385–388 ( DOI  10.1038 / nature13314 )

Ayrıca görün

İlgili Makaleler

Veri tabanı

  • ACNUC , CNRS / UMR5558 birimi tarafından sağlanan 3 büyük uluslararası nükleotid (GenBank ve EMBL) veya protein (UniProtKB) dizileri koleksiyonundan verileri yönetmek ve dağıtmak için bir araç ( veri tabanına başvurun )

Nükleotid hakkında topladığımız bilgileri yararlı bulduğunuzu umuyoruz. Cevabınız evet ise, lütfen bizi arkadaşlarınıza ve akrabalarınıza tavsiye etmeyi unutmayın ve bize ihtiyacınız olduğunda her zaman bizimle iletişime geçebileceğinizi unutmayın. Tüm çabalarımıza rağmen, _title hakkında sunduğumuz şeyin tamamen doğru olmadığını veya bir şeyler eklememiz veya düzeltmemiz gerektiğini düşünüyorsanız, bize bildirirseniz minnettar oluruz. Nükleotid ve diğer herhangi bir konu hakkında en iyi ve en kapsamlı bilgiyi sağlamak bu web sitesinin özüdür; ansiklopedi projesinin yaratıcılarına ilham veren aynı ruh tarafından yönlendiriliyoruz ve bu nedenle bu web sitesinde Nükleotid hakkında bulduklarınızın bilginizi genişletmenize yardımcı olduğunu umuyoruz.

Opiniones de nuestros usuarios

Cian Akkaya

Dil eski görünüyor, ancak bilgiler güvenilir ve genel olarak Nükleotid hakkında yazılan her şey çok fazla güven veriyor.

Mehmed Yavuz

Nükleotid ile ilgili güzel bir yazı olmuş. Gereken bilgileri aşırıya kaçmadan veriyor.

Faysal Uğur

Doğru. Nükleotid hakkında gerekli bilgileri sağlar.

Emel Aras

Bu yazıda Nükleotid hakkında bilmediğim şeyler öğrendim, bu yüzden şimdi yatağa gidebilirim.