| Eozinofil peroksidaz | ||
| Ana Özellikler | ||
|---|---|---|
| Sembol | EPX | |
| Eş anlamlı | EPO, EPP, EPX-PEN | |
| EC No. | 1.11.1.7 | |
| Homo sapiens | ||
| Yer yer | 17 q 22 | |
| Moleküler ağırlık | 81.040 Da | |
| Kalıntı sayısı | 715 amino asit | |
| İçeri gel | 8288 | |
| HUGO | 3423 | |
| OMIM | 131399 | |
| UniProt | P11678 | |
| RefSeq ( mRNA ) | NM_000502.5 | |
| RefSeq ( protein ) | NP_000493.1 | |
| Birlikte | ENSG00000121053 | |
|
GENATLAS • GeneTests • GoPubmed • HCOP • H-InvDB • Treefam • Vega | ||
| Erişilebilir Bağlantılar GeneCards ve HUGO . | ||
| EC No. | EC |
|---|---|
| CAS numarası |
| IUBMB | IUBMB girişi |
|---|---|
| IntEnz | IntEnz görünümü |
| BRENDA | BRENDA girişi |
| KEGG | KEGG girişi |
| MetaCyc | Metabolik yol |
| PRIAM | Profil |
| PDB | Yapılar |
| GİT | AmiGO / EGO |
Bir eosinofil peroksidaz , hemen hemen her zaman yazılı eozinofil peroksidaz ( EPO ), bir bir oksidoredüktaz katalize bir kimyasal reaksiyon Çeşidi:
H 2 O 2+ Br - → BrO - + H 2 O.Bu enzim içinde mevcut olan eozinofilik granülositlerin , hücreler arasında doğuştan gelen bağışıklık sistemi ve memelilerde . Olarak , insanlarda , bu bir kodlanmış ile EPX geni üzerinde bulunan kromozom 17 , ve ifade içinde miyelositler . Miyeloperoksidaz (MPO), laktoperoksidaz (LPO) ve tiroperoksidaz (TPO) gibi ortolog peroksidazlarla birçok benzerliği paylaşır .
Bu protein, konsantre edilir granüller arasında salgılanması eozinofillerde. Bu bir heme peroksidaz edebilen oksitleyici halid üretmek için oksijen reaktif türevleri bakteri , yok etme teşvik katyon arasında bakteriyel hücre duvarı ve katalize post-translasyonel modifikasyonlar arasında artıkları arasında asitler, aminler .
Heme peroksidaz| Pfam | PF00141 |
|---|---|
| InterPro | IPR002016 |
| PROSİTE | PDOC00394 |
| KAPSAM | 1 sa. |
| SÜPER AİLE | 1 sa. |
| CDD | cd00314 |
Bu enzimin ana fonksiyonu oksidasyonunu katalize etmek x halojenürler - için XO hipohalitler - kullanarak hidrojen peroksit , H 2 O 2Esas olarak etkiyen enzim , Br bromür - elde Bro - hipobromitler . Ancak, aynı zamanda üzerinde hareket edebilir klorürler Cl - ve iyodürlerden ben - yanı sıra üzerinde tıyosiyanatlar SCN - ait Psödohalojen ailesi . Bromürler fizyolojik olarak en çok kullanılanlarsa, bu enzimin reaksiyon hızı tiyosiyanatlar için, sonra iyodürler için en yüksektir; Klorürler, bu enzim için en az verimli substratlardır, katalitik hızları iyodürlerden beş kat daha yavaştır: aslında, yalnızca miyeloperoksidazlar klorürleri etkili bir şekilde oksitleyebilir.
Protein, nihai olarak granüller içinde taşınması gerektiğinden , pürüzlü endoplazmik retikulum yüzeyinden ribozomlar tarafından üretilir . Protein öncüsü elde edilen çeviri ile ribozomlar , ağır zincir ve hafif zincir, sırasıyla, 52 içine yarılır kDa ve 15 kDa . Bununla birlikte, bu iki zincir, özellikle heme aracılığıyla, yakından bağlantılı kalır.
Eozinofil peroksidaz, esas olarak a sarmallarından oluşan ve heme içeren bir enzimdir . Aktif bölgenin bulunduğu katalitik alanın çekirdeği , beşi ağır zincirde ve biri hafif zincirde olmak üzere altı a sarmalı içerir . Bu enzimin katlanma modu, bir heme peroksidazınki olarak bilinir ve bu ailenin tüm üyelerinde korunur, ancak bunların tümü peroksidaz tipi enzimatik aktiviteye sahip değildir .
Ca2 + kalsiyum iyon bağlama bölgesi , tipik bir bipiramidal beşgen geometri sergiler. Sekiz ağır zincir kalıntısından oluşur . This iyon koordinatları hidroksillerin ve serin ve treonin kalıntıları , karboniller ve peptit bağları , hem de karboksilleri arasında yan zincirleri hafif zincirinden bunlardan biri. Kalsiyum bağlanma sahası, sadece protein katlanmasının stabilize edilmesinde değil, aynı zamanda iki polipeptit zincirinin birleşmesinde de rol oynar. Kalsiyumun uzaklaştırılması, proteinin çözeltiden çökelmesine neden olur.
Eozinofil peroksidaz yalnızca bir alan içerir ve monomerik formda bulunur. Hücre sinyallemesinde neredeyse hiçbir rol oynamaz . Dört genel yapısı peroksidazlar heme de memelilerde ( laktoperoksidaz , miyeloperoksidaz , tiroid peroksidaz , eozinofil peroksidaz), büyük ölçüde aynıdır. Bununla birlikte, miyeloperoksidaz, disülfid bağlantılı katalitik bir dimer olarak ortaya çıkmasıyla ayırt edilir . Eozinofil peroksidaz, 7.62'lik bir izoelektrik noktası ile güçlü bir şekilde katyoniktir . Üçüncül yapısı, X-ışını kristalografisi ile karakterize edilmemiştir , ancak yapısı, peptit sekanslarının benzerliği ve absorpsiyon spektrumları dikkate alınarak, tiroperoksidaz ve laktoperoksidazınkiyle analoji yoluyla çıkarılabilir .
Eozinofil peroksidazın aktif bölgesi, protoporfirin IX ile bir tetradentat kompleksi oluşturan tek bir demir atomu içerir . Bu protez grubu , Asp232 ve Glu380 kalıntılarındaki ester bağları aracılığıyla polipeptide kovalent olarak bağlanır . Karşılaştırma ile, miyeloperoksidaz Tortu, üçüncü bir bağ noktasını içeren Met243 bir geçiş sülfonyum köprüsü bir ile vinil grubu arasında heme ; bu oluşum, karşılık gelen kalıntının bir treonin olduğu eozinofil peroksidazda yoktur .
Demir atomunun beşinci ligandı , bir asparagin kalıntısına bir hidrojen bağıyla bağlanmış, korunmuş bir histidin kalıntısıdır . Bu iki kritik kalıntı, demir atomunun kataliz için uygun bir Fe 3+ / Fe2 + redoks potansiyeline sahip olmasını sağlar . Altıncı ligand, hemın distal tarafında bulunur. Histidin, glutamin ve arginin kalıntıları ile hidrojen bağları ile stabilize edilmiş beş su molekülünden oluşan küçük bir ağdan oluşur. Heme'nin uzak tarafında, substratın proteine bağlanması ve enzim tarafından katalize edilen reaksiyonun gerçekleşmesi söz konusudur.
Hem peroksidazların temel mekanizması hidrojen peroksit H 2 O 2 kullanmaktır.demir atomunun +4 oksidasyon durumuna ulaştığı aktive edilmiş bir heme formu üretmek için . Aktif oksijen, reaktif oksijen türevi yapmak için bir substrata aktarılabilir . Bir eozinofil peroksidazda gerçekleşebilecek üç farklı döngü vardır.
1 st döngüsüİlki bir halojenleme döngüsüdür :
[Fe (III) ... Por ] + H 2 O 2→ [Fe (IV) = O ... Por • + ] + H 2 O.Heme'nin bu aktive hali, bir oksifiril grubu içeren bileşik I olarak adlandırılır . Porfirin pik-katyonik radikalinin, kimyasal reaktivitesini, kendisini oluşturan dört halkanın bağlantısını sağlayan metin köprüleri seviyesine taşıdığına inanılmaktadır . X - halojenürlerin varlığında bileşik I'in indirgenmesi şu şekilde gerçekleşir:
[Fe (IV) = O ... Por • + ] + X - → [Fe (III) ... Por ] + HOX .Bileşik I böylece enzimin başlangıç durumuna indirgenir ve uzak boşlukta bağlanan halojenür iyonları güçlü oksidanlara oksitlenir.
2 e döngüsüBununla birlikte, bileşik I'in radikaller oluşturmak için tek elektronlu bir işlemle substratları oksitleyebildiği ikinci bir döngü vardır . Bu, halojenür olmayan çoğu substrat için gözlemlenir:
[Fe (III) ... Por ] + H 2 O 2→ [Fe (IV) = O ... Por • + ] + H 2 O ; [Fe (IV) = O ... Por • + ] + RH → [Fe (IV) = O ... Por ] + R • + H + ; [Fe (IV) = O ... Por ] + RH → [Fe (III) ... Por ] + R • + H 2 O.Bu ikinci mekanizmanın fizyolojik etkileri önemlidir, çünkü eozinofil peroksidazın, reaktif türevler, oksijen yoluyla kademeli hücre sinyalleme mekanizmaları ile ilişkilendirilen proteinler üzerindeki tirozin kalıntılarını oksitleyebildiği gösterilmiştir .
3 e döngüsüÜçüncü reaksiyon döngüsü olmasıdır katalaz aktivitesi arasında peroksidazlar . Sadece tek elektron vericilerinin yokluğunda işe yarıyor gibi görünüyor.
[Fe (III) ... Por ] + H 2 O 2→ [Fe (IV) = O ... Por • + ] + H 2 O ; [Fe (IV) = O ... Por • + ] + H 2 O 2→ [Fe (III) ... Por ] + O 2+ H 2 O.