Arabidopsis

Arabidopsis Arabidopsis thaliana Sınıflandırma

Saltanat	Plantae
Bölünme	Magnoliophyta
Sınıf	Magnoliopsida
Sipariş	Capparales
Aile	Brassicaceae

Tür

Arabidopsis
Heynh. , 1842

Filogenetik sınıflandırma

Filogenetik sınıflandırma

Sipariş	Brassicales
Aile	Brassicaceae

Arabidopsis bir olan cins içinde otsu bitkiler arasında ailenin içinde Brassicaceae . Lahana ve hardala benzeyen küçük bitkilerdir. Bu cins,bitki biyolojisi ve temel biyolojide kullanılan bir model organizma olan Arabidopsis thaliana , Thalius yengeci veya bayan yengeci içerdiğinden büyük ilgi görmektedir .

Etimoloji

Arabistan, Arabistan'dan Latince "arabis": Arabistan çölleri gibi genellikle kuru ve kumlu topraklarda büyüyen bitkiler. "( Hippolyte Coste Florası ) Yunanca" opsis ", görünüm: bir arabisin alışkanlığı" ( Paul Fournier Florası )

Yeniden sınıflandırma

Şu anda, Arabidopsis cinsinin dokuz türü ve sekiz ek tanınmış alt türü vardır . Bu sınıflandırma oldukça yenidir ve O'Kane & Al-Shehbaz'ın (1997, 2003) filogenik morfolojik ve moleküler çalışmalarına dayanmaktadır.

Onların analizleri, daha önce cins sınıflandırılan türler teyit Arabidopsis ' idi polyphyletic . En son yeniden sınıflandırma iki eski cins yerleştirilen türlerin repositiones Cardaminopsis ve Hylandra ve üç tür Arabis cins içinde Arabidopsis , ancak hariç tutulacaklar yeni cins içinde yeniden sınıflandırılmıştır 50 türler: Beringia , Crucihimalaya , Ianhedgea , Olimarabidopsis , Pseudoarabidopsis ... ( Aşağıdaki listeye bakın )

Tüm Arabidopsis türleri Avrupa'ya özgüdür, türlerin ikisi de Kuzey Amerika ve Asya'ya kadar uzanan geniş aralıklara sahiptir .

1980'lerden beri Arabidopsis thaliana , genetik ve moleküler biyoloji çalışmaları için bilimsel toplulukta kullanılan bir model organizma olarak ortaya çıktı . Bu küçük bitki, bu beş kromozomun DNA dizisi 2000'den beri tam olarak bilinen küçük bir genoma (yaklaşık 120 Mb) sahiptir.

Türlerin ve varyantların listesi

• Arabidopsis arenosa (L.) Lawalrée, 1960
• Arabidopsis arenosa subsp. Arenosa

Dağıtım: Avrupa: yerli Almanya, Avusturya, Beyaz Rusya, Bosna Hersek, Bulgaristan, Hırvatistan, Çek Cumhuriyeti, Kuzeydoğu Fransa, Macaristan, Kuzey İtalya, Letonya, Litvanya, Makedonya, Polonya, Romanya, Slovakya, Slovenya, İsviçre, Ukrayna ve Yugoslavya; Belçika, Danimarka, Estonya, Finlandiya, Hollanda, Norveç, Rusya ve Batı Sibirya ve İsveç'te vatandaşlığa kabul edildi; Arnavutluk, Yunanistan, orta ve güney İtalya ve Türkiye'de yoktur.

• A. arenosa subsp. Borbaşı

Dağıtım: Doğu Belçika, Çek Cumhuriyeti, Kuzeydoğu Fransa, Almanya, Macaristan, Polonya, Romanya, Slovakya, İsviçre, Ukrayna. Danimarka'da doğrulanmamış varlık.

• Arabidopsis cebennensis (DC)

Dağıtım: SE Fransa.

• Arabidopsis croatica (Schott)

Dağıtım: Bosna, Hırvatistan.

• Arabidopsis halleri (L.)
• Arabidopsis halleri subsp. Halleri

Dağıtım: Avusturya, Hırvatistan, Çek Cumhuriyeti, Almanya, İtalya, Polonya, Romanya, Slovakya, Slovenya, İsviçre ve Ukrayna. Muhtemelen Fransa'da tanıtıldı ve Belçika'da yok oldu.

• Arabidopsis halleri subsp. Ovirensis (Wulfen)

Dağıtım: Arnavutluk, Avusturya, NE İtalya, Romanya, Slovakya, Slovenya, SO Ukrayna, Yugoslavya.

• Arabidopsis halleri subsp. Gemmifera (Matsumura)

Dağıtım: Rusya Uzak Doğu, Kuzeydoğu Çin, Kore, Japonya ve Tayvan.

• Arabidopsis lyrata (L.)
• Arabidopsis lyrata subsp. Lyrata

Dağıtım: NE Avrupa Rusya, Alaska, Kanada (Batı Ontario'dan Britanya Kolombiyası'na), SE, C ABD.

• Arabidopsis lyrata subsp. petraea (Linnaeus)

Dağıtım: Avusturya, Çek Cumhuriyeti, İngiltere, Almanya, Macaristan, İzlanda, İrlanda, K. İtalya, Norveç, NO Rusya, Sibirya ve Rusya Uzak Doğu, İskoçya, İsveç, Ukrayna, Alaska ve Yukon. Görünüşe göre Polonya'da soyu tükenmiş.

• Arabidopsis lyrata subsp. Kamchatica (Fischer, DC'den)

Dağıtım: Boreal Alaska, Kanada (Yukon, Mackenzie Bölgesi, Britanya Kolombiyası, NE Saskatchewan), Aleut Adaları, E Sibirya, Rusya Uzak Doğu, Kore, Kuzey Çin, Japonya ve Tayvan.

• Arabidopsis neglecta (Schultes)

Dağıtım: Karpatlar, Polonya, Romanya, Slovakya ve E Ukrayna.

• Arabidopsis pedemontana (Boiss.)

Dağıtım: İtalya HAYIR ve muhtemelen İsviçre'de soyu tükenmiş.

• Arabidopsis suecica (Kızartmalar) Norrlin, Meddel.

Dağıtım: Fennoscandinavia ve Baltık.

• Arabidopsis thaliana (L.) Heynh.

Dağıtım: Avrupa ve Orta Asya, artık dünya çapında vatandaşlığa alındı. Genetikte kullanılan model organizma .

Sitogenetik

Sitogenetik analizler, haploid kromozom sayısının değişken olduğunu ve n = 5, 8, 13 veya 16 olabileceğini göstermiştir.

• Arabidopsis thaliana  ; n = 5 ve bu türün tam DNA dizisi 2001'den beri bilinmektedir.
• Arabidopsis suecica  ; n = 13 ve Arabidopsis thaliana ve Arabidopsis arenosa arasındaki melezlemeden kaynaklanan bir amfidiploid türdür .
• Arabidopsis neglecta  ; A. halleri'nin birçok alt türü gibi n = 8.

A. lyrata ve A. arenosa'nın birçok alt türü n = 8 (diploid) veya n = 16 (tetraploid) olabilir.

A. cebennensis, A. croatica ve A. pedemontana sitolojik olarak analiz edilmemiştir (2005'te).

Yeniden sınıflandırılan türler

Daha önce Arabidopsis cinsine yerleştirilen aşağıdaki türlerin artık bu cinse ait olduğu düşünülmemektedir:

• A. bakteri =
• A. brevicaulis = Crucihimalaya himalaica
• A. bursifolia = Beringia bursifolia
• A. campestris = Crucihimalaya wallichii
• A. dentata = Murbeckiella pinnatifida
• A. drassiana =
• A. erysimoides = Erysimum hedgeanum
• A. eseptata = Olimarabidopsis umbrosa
• A. gamosepala = Neotorularia gamosepala
• A. glauca = Thellungiella salsuginea
• A. griffithiana = Olimarabidopsis pumila
• A. himalaica = Crucihimalaya himalaica
• A. huetii = Murbeckiella huetii
• A. kneuckeri = Crucihimalaya kneuckeri
• A. korshinskyi = Olimarabidopsis cabulica
• A. lasiocarpa = Crucihimalaya lasiocarpa
• A. minutiflora = Ianhedgea minutiflora
• A. mollis = Beringia bursifolia
• A. mollissima = Crucihimalaya mollissima
• A. monachorum = Crucihimalaya lasiocarpa
• A. mongolica = Crucihimalaya mongolica
• A. multicaulis = Arabis tibetica
• A. novae-anglicae = Neotorularia humilis
• A. nuda = Drabopsis nuda
• A. ovczinnikovii = Crucihimalaya mollissima
• A. parvula = Thellungiella parvula
• A. pinnatifida = Murbeckiella pinnatifida
• A. pumila = Olimarabidopsis pumila
• A. qiranica = Sisymbriopsis mollipila
• A. richardsonii = Neotorularia humilis
• A. russeliana = Crucihimalaya wallichii
• A. salsuginea = Thellungiella salsuginea
• A. sarbalica = Crucihimalaya wallichii
• A. schimperi = Robeschia schimperi
• A. stenocarpa = Beringia bursifolia
• A. stewartiana = Olimarabidopsis pumila
• A. stricta = Crucihimalaya stricta
• A. taraxacifolia = Crucihimalaya wallichii
• A. tenuisiliqua = Arabis tenuisiliqua
• A. tibetica = Crucihimalaya himalaica
• A. tibetica = Arabis tibetica
• A. toxophylla = Pseudoarabidopsis toxophylla
• A. trichocarpa = Neotorularia humilis
• A. trichopoda = Beringia bursifolia
• A. tschuktschorum = Beringia bursifolia
• A. tuemurnica = Neotorularia humilis
• A. verna = Drabopsis nuda
• A. virgata = Beringia bursifolia
• A. wallichii = Crucihimalaya wallichii
• A. yadungensis =

Kaynaklar

• O'Kane Jr, SL ve Al-Shehbaz, IA (1997). Arabidopsis'in (Brassicaceae) bir özeti: Novon 7: 323-327.
• Al-Shehbaz, IA, O'Kane, Steve L. (2002). Arabidopsis'in (Brassicaceae) Taksonomisi ve Filogenisi. Arabidopsis Kitabı: 1-22. Çevrimiçi sürüm.
• O'Kane Jr, SL ve Al-Shehbaz, IA (2003). Nükleer ribozomal DNA dizilerine dayalı Arabidopsis'in (Brassicaceae) filogenetik konumu ve jenerik sınırları: Missouri Botanik Bahçesi Yıllıkları 90 (4): 603-612

Notlar ve referanslar

1. Tropicos.org. Missouri Botanik Bahçesi., 28 Temmuz 2020'de erişildi.

Dış bağlantılar

• (en) Tropicos referansı  : Arabidopsis Heynh. ( + alt taksonların listesi )
• TAIR : Arabidopsis Bilgi Kaynağı
• (fr + en) ITIS referansı  : Arabidopsis Heynh. (+ İngilizce versiyonu ) (danışıldıŞubat 28, 2017)
• (en) NCBI referansı  : Arabidopsis ( taksonlar dahil ) (bkz.Şubat 28, 2017)
• (en) BioLib referansı  : Arabidopsis Heynh. (danışıldıŞubat 28, 2017)
• Referans Tela Botanica ( Fransa metrosu ): Arabidopsis Heynh. (danışıldıŞubat 28, 2017)