Bir izopeptit bağı , proteinin ana zincirinde bulunan bir peptit bağıdır . Bu bağlantı, bir yan zincirin " karboksilik asit " ve " amino grubu " fonksiyonları arasında oluşturulur (Şekil 1).
İzopeptit bağları, lisin yan zincirinin amini ile glutamat veya aspartatın yan zincirinin karboksil grupları arasında oluşabilir .
Bağ oluşumu, transglütaminazlar tarafından katalize edilen lizin ve glutamin arasında oluşan bağ durumunda olduğu gibi enzimatik olarak katalize edilebilir veya pili içinde bakteriofaj HK97 ve Gram pozitif bakterilerin kapsidinin oluşumunda gözlemlendiği gibi kendiliğinden oluşabilir. .
Bir izopeptit bağının kendiliğinden oluşumu, yakınlıktan kaynaklanan bağların oluşumunu katalize eden başka bir kalıntının, glutamik asidin varlığını gerektirir .
Bir izopeptid bağı içeren küçük bir peptidin bir örneği, bir glutamat kalıntısının yan zinciri ile bir sistein kalıntısının amin grubu arasında bir bağlantıya sahip olan glutatyondur .
İzopeptit bağlanmasında rol oynayan bir proteine örnek, ubikitinin C-terminal glisini ile substrat proteininin bir lizin yan zinciri arasında bağlanarak diğer proteinlere bağlanan ubikitindir.
İzopeptit bağlantıları, yaygın çeviri sonrası modifikasyonlardan biridir .
Son zamanlarda araştırmacılar, peptit izopeptag (in) adı verilen yeni bir etiket oluşturmak için bir izopeptit bağının kendiliğinden oluşumunu kullandılar .
İzopeptag, kovalent bir izopeptit bağı aracılığıyla bağlanma ortağıyla kendiliğinden ve geri döndürülemez şekilde reaksiyona girebilir.
Bu yeni moleküler aracın uygulamaları şunlar olabilir: proteinlerin in vivo hedeflenmesi, floresan mikroskobu ve sentetik biyoloji için yeni protein mimarilerinin geliştirilmesi .