Lizozim

Lizozim
Lizozim makalesinin açıklayıcı görüntüsü
İnsan lizozim , N -asetilglikozaminin ve mannoz yeşil ( PDB  1REM )
Ana Özellikler
Onaylanmış ad Lizozim
Sembol LYZ
EC No. 3.2.1.17
Homo sapiens
Yer yer 12 q 15
Moleküler ağırlık 16 537  Da
Kalıntı sayısı 148  amino asit
Erişilebilir Bağlantılar GeneCards ve HUGO .
İçeri gel 4069
HUGO 6740
OMIM 153450
UniProt P61626
RefSeq ( mRNA ) NM_000239.2
RefSeq ( protein ) NP_000230.1
Birlikte ENSG00000090382
PDB 133L , 134L , 1B5U , 1B5V , 1B5W , 1B5X , 1B5Y , 1B5Z , 1B7L , 1B7M , 1B7N , 1B7O , 1B7P , 1B7Q , 1B7R , 1B7S , 1BB3 , 1BB4 , 1BB5 , 1C43 , 1C45 , 1C46 , 1C7P , 1CJ6 , 1CJ7 , 1CJ8 , 1CJ9 , 1CKC , 1CKD , 1CKF , 1CKG , 1CKH , 1D6P , 1D6Q , 1DI3 , 1DI4 , 1DI5 , 1EQ4 , 1EQ5 , 1EQE , 1GAY , 1GAZ , 1GB0 , 1GB2 , 1GB3 , 1GB5 , 1GB6 , 1GB7 , 1GB8 , 1GB9 , 1GBO , 1GBW , 1GBX , 1GBY , 1GBZ , 1GDW , 1GDX , 1GE0 , 1GE1 , 1GE2 , 1GE3 , 1GE4 , 1GEV , 1GEZ , 1GF0 , 1GF3 , 1GF4 , 1GF5 , 1GGF6 , 1GF7 , 1GGFE , 1GGF9 , 1GF7 , 1GGFE , 1GGF9 , 1GF9 1GFH , 1GFJ , 1GFK , 1GFR , 1GFT , 1GFU , 1GFV , 1HNL , 1I1Z , 1I20 , 1I22 , 1INU , 1IOC , 1IP1 , 1IP2 , 1IP3 , 1IP4 , 1IP5 , 1IP6 , 1IP7 , 1IWT , 1WVIWI , 1WIWI , 1WIWI , 1WIWI , 1WIWI , 1WIWI 1IWY , 1IWZ , 1IX0 , 1IY3 , 1IY4 , 1JKA , 1JKB , 1JKC , 1JKD , 1JSF , 1JWR , 1LAA , 1LHH , 1LHI , 1LHJ , 1LHK , 1LHL , 1LHM , 1LMT , 1LOZ , 1LYY , 1LZ1 , 1LZ4 , 1LZ5 , 1LZ6 , 1LZR , 1LZS , 1OP9 , 1OUA , 1OUB , 1OUC , 1OUD , 1OUE , 1OUF , 1OUG , 1OUH , 1YES , 1OUJ , 1QSW , 1RE2 , 1REM , 1REX , 1REY , 1REZ , 1TAY , 1TBY , 1TCY , 1TDY , 1UBZ , 1W08 , 1WQM , 1WQN , 1WQO , 1WQP , 1WQQ , 1WQR , 1YAM , 1YAN , 1YAO , 1YAP , 1YAQ , 207L , 208L , 2BQA , 2BQB , 2BQC , 2BQD , 2BQE , 2BQF , 2BQG , 2BQH , 2BQI , 2BQJ , 2BQK , 2BQL , 2BQM , 2BQN , 2BQO , 2HEA , 2HEB , 2HEC , 2HED , 2HEE , 2HEF , 2LHM , 2MEA , 2MEB , 2MEC , 2 MED , 2MEE , 2MEF , 2meg , 2MEH , 2MEI , 2NWD , 2ZIJ , 2ZIK , 2ZIL , 2ZWB , 3EBA , 3FE0 , 3LHM , 3LN2 , 4I0C , 4ML7 , 4R0P

GENATLAS GeneTests GoPubmed HCOP H-InvDB Treefam Vega

Lizozim 1 Beğen
Ana Özellikler
Onaylanmış ad Lizozim 1 Beğen
Sembol LYZL1
EC No. 3.2.1.17
Homo sapiens
Yer yer 10 sayfa 12.1
Moleküler ağırlık 16 654  Da
Kalıntı sayısı 148  amino asit
Erişilebilir Bağlantılar GeneCards ve HUGO .
İçeri gel 84569
HUGO 30502
UniProt Q6UWQ5
RefSeq ( mRNA ) NM_032517.4
RefSeq ( protein ) NP_115906,3
Birlikte ENSG00000120563

GENATLAS GeneTests GoPubmed HCOP H-InvDB Treefam Vega

Lizozim 2 Gibi
Ana Özellikler
Onaylanmış ad Lizozim 2 Gibi
Sembol LYZL2
EC No. 3.2.1.17
Homo sapiens
Yer yer 10 sayfa 11.23
Moleküler ağırlık 16 656  Da
Kalıntı sayısı 148  amino asit
Erişilebilir Bağlantılar GeneCards ve HUGO .
İçeri gel 119180
HUGO 29613
OMIM 612748
UniProt Q7Z4W2
RefSeq ( mRNA ) NM_183058.2
RefSeq ( protein ) NP_898881.2
Birlikte ENSG00000151033

GENATLAS GeneTests GoPubmed HCOP H-InvDB Treefam Vega

Lizozim veya muramidaz a, proteinin , uzun yüz Küresel amino asitleri bakteriyel enfeksiyonlara karşı savunma katılır (insanda 130). Birçok hayvan türünde (omurgalılar, böcekler, akarlar ve bazı yumuşakçalar) bulunur. Özellikle bir takım salgılarda ( gözyaşı , tükürük , anne sütü , mukus ...) ve yumurta akında (tavuklarda 129 amino asit) bulunur.

Bir olan asidik glikosid hidrolaz ( AT tarafından salgılanan 3.2.1.17) granülosit ve monositler . Bu yok bakteriyel duvarı arasında Gram-pozitif bakteri katalizlerler hidroliz ait peptidoglikanlara devam etmesidir. Bu özellik, bazı yazarları Onu bedensel bir antibiyotik olarak nitelendirmeye sevk etti . Daha doğrusu lizozim, doğuştan gelen bağışıklığın bileşenlerinden biridir .

Bu protein, 1922'de Alexander Fleming tarafından keşfedildi .

Yumurta beyazı lizozim (tip-C), tatlandırıcı protein thaumatininkinden ( algılama eşiğinde ) 200 kat daha yoğun tatlı bir tada sahiptir .

Lizozim Bu görüntünün açıklaması, aşağıda da yorumlanmıştır Tavuk yumurtası lizoziminin tersiyer yapısı ( PDB  132l ) Anahtar veri
EC No. EC 3.2.1.17
CAS numarası 9001-63-2
Enzim aktivitesi
IUBMB IUBMB girişi
IntEnz IntEnz görünümü
BRENDA BRENDA girişi
KEGG KEGG girişi
MetaCyc Metabolik yol
PRIAM Profil
PDB Yapılar
GİT AmiGO / EGO
Lizozim tipi c / α-Lactalbumin Bu görüntünün açıklaması, aşağıda da yorumlanmıştır Bobwhite bıldırcın lizozimi ( PDB  1DKJ ) Protein alanı
Pfam PF00062
Klan Pfam CL0037
InterPro IPR001916
PROSİTE PDOC00716
KAPSAM 1e0g
SÜPER AİLE 1e0g
TCDB 9.B.41
CAZy GH22
CDD cd00119

Aksiyon modu

Lizozim, doğuştan gelen bir opsonin olarak veya bakterileri, özellikle de Gram-pozitif bakterileri, patojeniteleri ne olursa olsun parçalayabilen bir litik enzim olarak hareket edebilir . Öte yandan, Gram negatif bakteriler, onları karakterize eden lipopolisakkaritlerin (LPS) dış tabakası sayesinde genellikle bu enzime dirençlidir. Bu LPS tabakası, mureik duvarı (örneğin, bir peptidoglikan tabakası) örter ve bu enzime erişimini engelleyerek onu lizozimin saldırısına karşı korur.

Lizozim ve böylece bir negatif yük azaltılması ve kolaylaştırıcı, bakteriyel yüzeye takılarak bir doğuştan gelen spesifik olmayan opsonin olarak işlev görür fagositoz sistemi satın içinde opsoninlerin önce bakterilerin bağışıklık . Başka bir deyişle lizozim, lökositler tarafından fagositozu kolaylaştırır .

Bakteriyel parçalanma ile ilgili olarak, enzim, bakteri duvarını oluşturan peptidoglikanlara (özellikle Gram pozitif bakterilere ) saldırır . Arasında Gerçekten de, lizozim hidroliz kovalent bağlar (β1 → 4 glikosidik bağı) N-asetil-muramik ve 4 inci  karbon atomu N-asetil-glukozamin . Peptidoglikan molekülü, iki alan arasındaki bir girintide bulunan enzimin bağlanma sahası ( Bağlanma Yeri ) ile ilişkilidir . Bu, substrat molekülünü geçiş durumunun konformasyonunu benimsemeye zorlar. Amino asitleri Glu 35 ( glutamik asit, amino asit numarası 35), ve Asp 52 ( aspartik asit, bir amino asit numarası 52) enzimatik aktivitesi için esas olduğu gösterilmiştir. Glu 35 , glikosidik köprüde bir proton donörü olarak görev yapar ve substratın CO bağını keser, Asp 52 ise glikosile edilmiş bir enzimin geçici oluşumuna izin veren bir nükleofil görevi görür . Bu daha sonra bir su molekülü ile reaksiyona girerek hidrolizin son ürününü ve enzimi orijinal biçiminde verir.


Lizozime bağlı hastalıklar

Lizozim genindeki bir mutasyon , belirli dokularda amiloid proteinlerinin birikmesine neden olabilir .

Teşhis amaçlı kullanım

Kandaki artan lizozim seviyesi genellikle sarkoidoz ile bağlantılıdır . Değerleri 8  mg / L veya daha fazla kabul edilir en yüksek.

Referanslar

  1. (en) Bay Muraki, K. Harata, N. Sugita ve K. Sato , Man K1,4-GlcNAc'nin 2 ', 3'-Epoksipropil-p-glikositi ile Etiketlenmiş İnsan Lizoziminin X-ışını Yapısı. Yapısal Değişim ve alt site ile tanıma Özgünlük B  ” , Açta Crystallographica Section D - Structural Biology , vol.  54, n o  Pt 1, Eylül 1998, s.  834-843 ( PMID  9757098 , DOI  10.1107 / S090744499800122X , çevrimiçi okuyun )
  2. kütle değerleri ve kalıntıların sayısı burada belirtilen olanlardır protein öncüsünün elde edilen çeviri bölgesinin gen önce, post-translasyonel modifikasyonlar , ve karşılık gelen değerlerden önemli ölçüde farklı olabilir için işlevsel protein .
  3. Lenka Grunclov, Hélène Fouquier, Václav Hyps ve Petr Kopásek, Yumuşak kene Ornithodoros moubata'nın bağırsaklarından Lysozyme: sekans, filogeni ve beslenme sonrası düzenleme  ; Developmental & Comparative Immunology Cilt 27, Sayı 8, Eylül 2003, Sayfalar 651-660 doi: 10.1016 / S0145-305X (03) 00052-1 ( Özet )
  4. (en) Masuda, T. & Kitabatake, Tatlı proteinlerin biyoteknolojik üretimindeki gelişmeler. J. Biosci. Bioeng. 2006, 102, 375–389