Pyoverdine | |
Bir pyoverdinin yapısına örnek |
|
Kimlik | |
---|---|
Eş anlamlı |
psödobaktin |
N O CAS | |
PubChem | 45479427 (Pyoverdine tip I ) |
GÜLÜMSEME |
CC (C1C (= O) NC (C (= O) NCCCCC (C (= O) NC (C (= O) N1) CCCN (C = O) O) NC (= O) C (CCCN (C = O) )) O) NC (= O) C (CO) NC (= O) C (CCCN = C (N) N) NC (= O) C (CO) NC (= O) [C@H] 2CCNC3N2C4 = CC (= C (C = C4C = C3NC (= O) CCC (C (= O) O) N) O) O) C (C) O) O , |
InChI |
Std. InChI: InChI = 1S / C56H88N18O22 / c1-27 (79) 43-53 (91) 61-15-4-3-8-31 (46 (84) 65-34 (11-7-19-73 ( 96) 26-78) 49 (87) 70-44 (28 (2) 80) 54 (92) 71-43) 64-47 (85) 33 (10-6-18-72 (95) 25-77) 67-50 (88) 36 (23-75) 68-48 (86) 32 (9-5-16-62-56 (58) 59) 66-51 (89) 37 (24-76) 69-52 ( 90) 38-14-17-60-45-35 (63-42 (83) 13-12-30 (57) 55 (93) 94) 20-29-21-40 (81) 41 (82) 22- 39 (29) 74 (38) 45 / h 20-22.25-28.30-34.36-38.43-45.60.75-76.79-82.95-96H, 3-19.23- 24.57H2.1-2H3, (H, 61.91) (H, 63.83) (H, 64.85) (H, 65.84) (H, 66.89) (H, 67.88) (H, 68.86) (H, 69.90) (H, 70.87) (H, 71.92) (H, 93.94) (H4. 58.59.62) / t27 ?, 28?, 30 ?, 31 ?, 32 ?, 33 ?, 34 ?, 36 ?, 37 ?, 38-, 43 ?, 44 ?, 45? / M0 / s1 Std. InChIKey: QIRRYPHVUMPBDX-UARRTFJPSA-N |
Kimyasal özellikler | |
Kaba formül |
C 56 H 88 N 18 O 22 [İzomerler] (Tip I pyoverdin formülü ) |
Molar kütle | 1365.4053 ± 0.0612 g / mol C% 49.26, H% 6.5, N% 18.46, O% 25.78, |
Aksi belirtilmedikçe SI ve STP birimleri . | |
Bir pyoverdine bir siderofor floresan ve oligopeptid antibiyotik özellikle üretilen Pseudomonas aeruginosa ve Psödomonas fluorescens arasında, bakteriler için Gram-negatif . Şu anda yaklaşık altmış ilgili molekül bilinmektedir. Pyoverdinler , Pseudomonas için virülans faktörleri olarak hareket eder .
Enterobaktinin aksine , pyoverdinler, bir dihidroksikinolin türevi içeren ribozomal olmayan peptidlerdir . Peptidin yapısı türe göre farklılık gösterir ve yaklaşık kırk farklı yapı tanımlanırken, asit kromofor (1 S ) -5-amino-2,3-dihidro-8,9-dihidroksi-1H-pirimido [1, 2- bir ] haricinde değişmeden kinolin-1-karboksilik kalıntıları azobactine arasında Azotobacter vinelandii (en) , bir yer alır ilave üre halkası .
Nakit | Suşlar | Pyoverdin peptid zinciri * |
---|---|---|
P. aeruginosa | ATCC15692 | Q D -Ser-Arg D -Ser-FoOHOrn-c (Lys-FoOHOrn-Thr-Thr) |
P. aeruginosa | ATCC27853 | Q- D Ser-FoOH D Orn-Orn-Gly-a D Thr-Ser-cOHOrn |
P. aeruginosa | Pa6 | Q- D Ser-Dab-FoOHOrn-Gln- D Gln-FoOH D Orn-Gly |
P. chlororaphis | ATCC9446 | Q- D Ser-Lys-Gly-FoOHOrn-c (Lys-FoOH D Orn-Ser) |
P. fluorescens bv.I | ATCC13525 | Q- D Ser-Lys-Gly-FoOHOrn-c (Lys-FoOH D Orn-Ser) |
P. fluorescens bv.I | 9AW | Q- D Ser-Lys-OHHis-a D Thr-Ser-cOHOrn |
P. fluorescens bv.III | ATCC17400 | Q- D Ala- D Lys-Gly-Gly-OHAsp- D Gln / Dab -Ser- D Ala-cOHOrn |
P. fluorescens bv.V | 51 W | Q- D Ala- D Lys-Gly-Gly-OH D Asp- D Gln- D Ser-Ala-Gly-a D Thr-cOHOrn |
P. fluorescens bv.V | 1 W | Q- D Ser-Lys-Gly-FoOHOrn-c (Lys-FoOH D Orn-Ser) |
P. fluorescens bv.V | 10CW | Q- D Ser-Lys-Gly-FoOHOrn-c (Lys-FoOH D Orn-Ser) |
P. fluorescens bv.VI | PL7 | Q- D Ser-AcOH D Orn-Ala-Gly-a D Thr-Ala-cOHOrn |
P. fluorescens bv.VI | PL8 | Q- D Lys-AcOH D Orn-Ala-Gly-a D Thr-Ser-cOHOrn |
P. fluorescens | 1.3 | Q- D Ala- D Lys-Gly-Gly-OHAsp- D Gln / Dab-Gly-Ser-cOHOrn |
P. fluorescens | 18.1 | Q- D Ser-Lys-Gly-FoOHOrn-Ser- D Ser-Gly-c (Lys-FoOH D Orn-Ser) |
P. fluorescens | CCM 2798 | Q-Ser-Dab-Gly-Ser-OH D Asp-Ala-Gly- D Ala-Gly-cOHOrn |
P. fluorescens | CFBP 2392 | Q- D Lys-AcOH D Orn-Gly-a D Thr-Thr-Gln-Gly- D Ser-cOHOrn |
P. fluorescens | CHA0 | Q-Asp-FoOH D Orn-Lys-c (Thr-Ala-Ala-FoOH D Orn-Lys) |
P. putida bv. B | 9BW | Q- D Ser-Lys-OHHis-a D Thr-Ser-cOHOrn |
P. putida | CFBP 2461 | Q-Asp-Lys-OH D Asp-Ser-a D Thr-Ala-Thr- D Lys-cOHOrn |
P. tolaasii | NCPPB 2192 | Q- D Ser-Lys-Ser- D Ser-Thr-Ser-AcOHOrn-Thr- D Ser-cOH D Orn |
* Amino asitler üç harfle kısaltılır. Ayrıca şu kısaltmalar kullanılmaktadır: S = kromofor , D Xxx = D amino asit , ATHR = allo-treonin , bir D Thr = allo D -treonin , c = halka yapısı , cohorn = siklo-hydroxyornithine , Dab = diaminobütirik asit , Ac = asetil , Fo = formil , OH = hidroksil . |
Bu pyoverdins belirli artırabilir bitkisel arıtma işlemleri demir değil, aynı zamanda başka metaller (sideroforlar demir yakalama özellikle etkilidir, ama aynı zamanda da dahil olmak üzere 28 çift değerli metaller için iyi bir çekicilik gösterir Cd (II) ve Ni (II) eklenmiştir.